More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0248 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1766  phosphoglycerate kinase  85.18 
 
 		 398 aa  682    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0248  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 398 aa  788    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1755  phosphoglycerate kinase  85.96 
 
 		 399 aa  680    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.542191  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  67.58 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  63.95 
 
 		 404 aa  512  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  62.56 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl577  phosphoglycerate kinase  64.02 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  63.57 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  63.68 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  63.57 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  63.3 
 
 		 405 aa  491  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0631  phosphoglycerate kinase  59.06 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0347662  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  59.75 
 
 		 403 aa  463  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  57.67 
 
 		 655 aa  431  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  56.86 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  56.86 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  56.44 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  56.19 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  54.5 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  53.47 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf530  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0418919  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  53.96 
 
 		 402 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  54.23 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.36 
 
 		 646 aa  391  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  53.94 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.35 
 
 		 650 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  53.25 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  51.86 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  51.49 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  53.87 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  51.74 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  53.58 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  51.46 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  50.98 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  51.49 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  50.87 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  52.24 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  51.62 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  50.37 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  51.63 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  51.12 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  49.26 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  48.53 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  51.12 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  48.25 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  51.24 
 
 		 395 aa  364  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  47.79 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  47.79 
 
 		 396 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 400 aa  362  9e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  49.13 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  51.36 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  49.26 
 
 		 401 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  49.13 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  49.13 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  48.88 
 
 		 394 aa  358  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  50.62 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  49.14 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  48.89 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  49.39 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  48.88 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 397 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 395 aa  356  2.9999999999999997e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  50.51 
 
 		 435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  48.88 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  48.88 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  51.23 
 
 		 400 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  51.36 
 
 		 400 aa  354  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  48.63 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  48.89 
 
 		 402 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 401 aa  352  5e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  48.09 
 
 		 389 aa  352  5e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 		 394 aa  352  5e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  50.87 
 
 		 397 aa  349  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  49 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1715  phosphoglycerate kinase  49.04 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  48.62 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  48.39 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.13 
 
 		 395 aa  346  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 401 aa  346  5e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  48 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  49.02 
 
 		 406 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 401 aa  345  8e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 401 aa  344  1e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  47.75 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>