More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0184 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  64.09 
 
 
478 aa  648    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  62.55 
 
 
478 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  100 
 
 
478 aa  986    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  48.73 
 
 
467 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  45.53 
 
 
470 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  45.53 
 
 
470 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  45.95 
 
 
475 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  45.74 
 
 
475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  45.28 
 
 
474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  45.07 
 
 
469 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  42.16 
 
 
461 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  42.46 
 
 
465 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  40.08 
 
 
469 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl313  beta-glucosidase/alpha xylosidase  40.55 
 
 
469 aa  372  1e-101  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  42.41 
 
 
455 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4075  glycoside hydrolase family 1  40.42 
 
 
467 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl011  beta-glucosidase  39.87 
 
 
464 aa  360  3e-98  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  41 
 
 
466 aa  358  9.999999999999999e-98  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  40.51 
 
 
453 aa  348  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  39.52 
 
 
478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  40.09 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0968  glycoside hydrolase family 1  37.93 
 
 
480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0341  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  38.22 
 
 
485 aa  336  7e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  40.34 
 
 
451 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  38.98 
 
 
479 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  39.96 
 
 
452 aa  333  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0902  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  38.26 
 
 
486 aa  333  5e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0185  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  39.88 
 
 
496 aa  332  8e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000347604  hitchhiker  0.00387129 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1584  glycoside hydrolase family 1  39.05 
 
 
451 aa  332  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0927  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  40.08 
 
 
478 aa  332  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  38.28 
 
 
478 aa  330  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0785  glycoside hydrolase family protein  38.78 
 
 
479 aa  326  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  38.16 
 
 
479 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0224  6-phospho-beta-glucosidase  38.88 
 
 
480 aa  324  2e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  37.84 
 
 
453 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  37.87 
 
 
471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3733  glycoside hydrolase family 1  37.92 
 
 
478 aa  319  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0791  glycoside hydrolase family 1  37.9 
 
 
477 aa  318  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3060  6-phospho-beta-glucosidase BglA  37.9 
 
 
479 aa  318  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  38.94 
 
 
438 aa  318  9e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1544  beta-glucosidase  36.95 
 
 
478 aa  318  9e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0808  glycoside hydrolase family protein  37.9 
 
 
477 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.785665  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3228  6-phospho-beta-glucosidase BglA  37.9 
 
 
479 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02733  6-phospho-beta-glucosidase A  37.7 
 
 
479 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02696  hypothetical protein  37.7 
 
 
479 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4193  6-phospho-beta-glucosidase BglA  37.7 
 
 
479 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  37.9 
 
 
479 aa  317  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0765  6-phospho-beta-glucosidase  37.83 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3322  6-phospho-beta-glucosidase BglA  37.7 
 
 
479 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1307  glycoside hydrolase family protein  35.85 
 
 
458 aa  315  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  37.4 
 
 
477 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  37.4 
 
 
477 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  37.4 
 
 
477 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3965  glycoside hydrolase family protein  36.31 
 
 
487 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0012  glycoside hydrolase family 1  36.8 
 
 
480 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  39.07 
 
 
444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  37.45 
 
 
463 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  38.15 
 
 
478 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3208  6-phospho-beta-glucosidase BglA  37.2 
 
 
477 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.962709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  38.15 
 
 
478 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  37.95 
 
 
450 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  36.94 
 
 
478 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  38.41 
 
 
470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  37.2 
 
 
477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.276018 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0469  6-phospho-beta-glucosidase  38.1 
 
 
478 aa  310  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  39.04 
 
 
446 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  38.13 
 
 
478 aa  309  9e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3567  glycoside hydrolase family 1  36.53 
 
 
478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1348  glycoside hydrolase family 1  36.44 
 
 
487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.843045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0011  glycoside hydrolase family 1  36.2 
 
 
480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  37.42 
 
 
500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  36.14 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0340  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  36.82 
 
 
481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0543  glycoside hydrolase family 1  37.45 
 
 
462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  38.53 
 
 
474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0748  glycoside hydrolase family 1  36.44 
 
 
496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  38.83 
 
 
446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  38.38 
 
 
446 aa  307  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  37.82 
 
 
459 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  38.08 
 
 
470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1352  glycoside hydrolase family 1  37.88 
 
 
471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1705  glycoside hydrolase family 1  39 
 
 
465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  36.89 
 
 
488 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  37.97 
 
 
465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0749  glycoside hydrolase family 1  36.55 
 
 
465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2140  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  36.86 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854328  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2547  glycoside hydrolase family 1  36.27 
 
 
479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0806308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1821  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  37.78 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.230632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  38.35 
 
 
482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1407  glycoside hydrolase family 1  37.17 
 
 
464 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2793  glycoside hydrolase family 1  36.89 
 
 
473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0271062  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1637  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  38.82 
 
 
454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  37.01 
 
 
478 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3320  glycoside hydrolase family protein  37.1 
 
 
477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974893  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  38.6 
 
 
909 aa  304  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2481  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  36.86 
 
 
476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0764  glycoside hydrolase family 1  36.31 
 
 
489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  39.49 
 
 
482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  37.15 
 
 
474 aa  303  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3001  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  37.15 
 
 
474 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>