More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0173 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 446 aa  887    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  43.85 
 
 		 458 aa  351  1e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  40.32 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  41.5 
 
 		 522 aa  329  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  43.61 
 
 		 408 aa  323  4e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  38.81 
 
 		 494 aa  300  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  38.91 
 
 		 500 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  36.2 
 
 		 453 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  32.36 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  33.83 
 
 		 451 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  35.67 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  32.18 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 457 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  34.2 
 
 		 449 aa  199  9e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  32.48 
 
 		 443 aa  199  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  31.34 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  31.4 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  31.11 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 469 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 469 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 469 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 453 aa  139  8.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  29.28 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  29.28 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  29.28 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  29.28 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.28 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29.28 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  28.53 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  28.95 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  26.67 
 
 		 468 aa  136  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.25 
 
 		 482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.98 
 
 		 496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 480 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  29.01 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 503 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  27.78 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  26.37 
 
 		 491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  27.39 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  30.79 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 494 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  27.87 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 473 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 467 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 485 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  22.12 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.22 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 458 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  25.58 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 525 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 464 aa  99.8  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 458 aa  99.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 476 aa  99.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 509 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  30.95 
 
 		 238 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.49 
 
 		 466 aa  97.4  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1507  mate efflux family protein  24.81 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  28.15 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 460 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 462 aa  94  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>