More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0159 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
382 aa  803  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  85.45 
 
 
380 aa  685  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  82.01 
 
 
380 aa  667  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.02 
 
 
379 aa  588  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.02 
 
 
379 aa  584  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.51523e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.96 
 
 
379 aa  581  1e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.70513e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.96 
 
 
379 aa  581  1e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.48017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.96 
 
 
379 aa  581  1e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.10592e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.96 
 
 
379 aa  581  1e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.28432e-05 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.15 
 
 
380 aa  583  1e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.96 
 
 
379 aa  581  1e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.8864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.96 
 
 
379 aa  581  1e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.75969e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.96 
 
 
379 aa  581  1e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.56565e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.69 
 
 
379 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.27158e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.69 
 
 
379 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.29 
 
 
380 aa  577  1e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.08 
 
 
379 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.08 
 
 
379 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.02 
 
 
379 aa  526  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.17 
 
 
374 aa  514  1e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.9 
 
 
375 aa  504  1e-142  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.17 
 
 
373 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.97 
 
 
372 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.77 
 
 
373 aa  498  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.56741e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0376  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  60 
 
 
406 aa  497  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0401753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.87 
 
 
373 aa  481  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.03 
 
 
370 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.22 
 
 
372 aa  479  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.78 
 
 
370 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.78979e-06  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1289  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  62.64 
 
 
347 aa  470  1e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.78 
 
 
369 aa  469  1e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.22 
 
 
379 aa  459  1e-128  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.68 
 
 
370 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.42 
 
 
371 aa  446  1e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.32 
 
 
372 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.17 
 
 
367 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.59 
 
 
373 aa  439  1e-122  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.04 
 
 
372 aa  440  1e-122  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.41 
 
 
384 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.18 
 
 
387 aa  432  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.22 
 
 
368 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.87 
 
 
379 aa  428  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.46 
 
 
357 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.83 
 
 
369 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.14064e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.52 
 
 
394 aa  425  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.5 
 
 
369 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.95 
 
 
368 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.65402e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.34 
 
 
392 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 
368 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  6.43926e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.67 
 
 
372 aa  417  1e-115  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.29 
 
 
374 aa  416  1e-115  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.88 
 
 
368 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.84 
 
 
371 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.88 
 
 
368 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.99 
 
 
380 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.91 
 
 
375 aa  407  1e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.84 
 
 
370 aa  407  1e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.31 
 
 
355 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.38291e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.81 
 
 
371 aa  399  1e-110  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  52.28 
 
 
382 aa  399  1e-110  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.81 
 
 
371 aa  399  1e-110  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
377 aa  399  1e-110  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
376 aa  395  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.97 
 
 
382 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
380 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.73 
 
 
378 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 
384 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.87 
 
 
381 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 
372 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
388 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.63 
 
 
395 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.19 
 
 
374 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
377 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
373 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.70638e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.33 
 
 
392 aa  392  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.8 
 
 
380 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.8 
 
 
380 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.05 
 
 
392 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 
366 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.49 
 
 
336 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.84 
 
 
387 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 
374 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.52098e-07  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.61 
 
 
381 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.74 
 
 
379 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.2 
 
 
371 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.05 
 
 
392 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.33 
 
 
383 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 
366 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 
377 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 
374 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  1.18913e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 
374 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.28041e-06  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.91 
 
 
385 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
377 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
375 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.72 
 
 
387 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  52.78 
 
 
375 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
375 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
375 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
375 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.87089e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
375 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>