More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0113 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
387 aa  754    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  48.68 
 
 
400 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  48.68 
 
 
400 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  47.83 
 
 
400 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  47.83 
 
 
400 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  47.83 
 
 
400 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  48.08 
 
 
400 aa  295  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  48.08 
 
 
400 aa  295  8e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  48.08 
 
 
400 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  47.83 
 
 
400 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  47.57 
 
 
400 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  39.02 
 
 
387 aa  276  6e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  38.64 
 
 
388 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  38.64 
 
 
388 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  39.49 
 
 
398 aa  269  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
387 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
389 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.79 
 
 
370 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.7 
 
 
391 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  31.03 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
426 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
408 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  30.32 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  28.28 
 
 
426 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
424 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.69 
 
 
386 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  28.5 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
402 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
413 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
414 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
413 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
423 aa  123  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
413 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
427 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  29.4 
 
 
413 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
407 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.79 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.13 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
406 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  27.79 
 
 
401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  26.65 
 
 
421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.97 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  27.95 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  27.56 
 
 
399 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  26.87 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  26.86 
 
 
397 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  27.56 
 
 
399 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  27.56 
 
 
399 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  26.03 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  30.97 
 
 
398 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
398 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  26.8 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  27.14 
 
 
424 aa  113  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  28.68 
 
 
412 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.58 
 
 
416 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.94 
 
 
408 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  26.99 
 
 
397 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  26.55 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.26 
 
 
414 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  29.81 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  26.72 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  31.25 
 
 
391 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  31.25 
 
 
391 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  30.98 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  30.98 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  24.59 
 
 
422 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  30.03 
 
 
400 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
398 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  24.86 
 
 
419 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  24.86 
 
 
421 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  28.76 
 
 
391 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  24.81 
 
 
411 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  25.69 
 
 
419 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  26.4 
 
 
417 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
434 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  28.06 
 
 
405 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
430 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  27.43 
 
 
416 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
396 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  25.45 
 
 
405 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  27.51 
 
 
397 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
397 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  24.04 
 
 
411 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
425 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  24.27 
 
 
411 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1298  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
402 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.148337  normal  0.167522 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  29.11 
 
 
391 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  29.77 
 
 
391 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 
411 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
394 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  27.61 
 
 
412 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
401 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  28.69 
 
 
406 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  25.74 
 
 
415 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>