23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0110 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  100 
 
 		 152 aa  314  3e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  59.72 
 
 		 256 aa  175  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  59.15 
 
 		 232 aa  174  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  59.29 
 
 		 290 aa  170  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  61.72 
 
 		 144 aa  160  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  63.06 
 
 		 207 aa  153  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  51.39 
 
 		 303 aa  153  9e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  50 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  47.37 
 
 		 324 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  38.82 
 
 		 176 aa  99.4  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  47.41 
 
 		 483 aa  96.3  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  48.91 
 
 		 416 aa  96.3  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  43.04 
 
 		 427 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.95 
 
 		 693 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  32.56 
 
 		 643 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  31.36 
 
 		 815 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  29.63 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  37.65 
 
 		 514 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.78 
 
 		 606 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.58 
 
 		 638 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  34 
 
 		 633 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35 
 
 		 595 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  30.51 
 
 		 808 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>