44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0099 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  338  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2420  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2018  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000120097  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0154  adc operon repressor AdcR  27.72 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  28.87 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 220 aa  44.3  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0270  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 113 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 334 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>