29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0095 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  682    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0938  integral membrane protein  31.28 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000154072  normal  0.402272 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  35.77 
 
 
188 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  26.83 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0312  hypothetical protein  26.94 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.904588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  31.47 
 
 
191 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  26.13 
 
 
194 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  34.78 
 
 
193 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  34.78 
 
 
193 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  31.25 
 
 
190 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  31.06 
 
 
193 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  32.31 
 
 
195 aa  60.1  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  28.47 
 
 
191 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  28.65 
 
 
203 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  29.92 
 
 
199 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  27.84 
 
 
218 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  32.29 
 
 
194 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  29.85 
 
 
190 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  28.68 
 
 
191 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  33.33 
 
 
191 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  29.67 
 
 
205 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  26.14 
 
 
199 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  32.97 
 
 
218 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  26.89 
 
 
212 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  32.98 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  26.37 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>