More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0091 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 		 318 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  38.85 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  34.65 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  30.9 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  28.69 
 
 		 256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  26.64 
 
 		 395 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  26.64 
 
 		 437 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 224 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.85 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  26.64 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  26.64 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  27 
 
 		 437 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 		 378 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 510 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  29.93 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 282 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  26.47 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 273 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  29.36 
 
 		 273 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  29.2 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 273 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 273 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  28.24 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  26.87 
 
 		 590 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 275 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 627 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  24.54 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 354 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 234 aa  92  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 659 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 660 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  34.1 
 
 		 373 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  23.77 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 645 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 659 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.31 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.31 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 271 aa  89  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  23.92 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  27.78 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  26.89 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  27.43 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 		 1015 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  24.36 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  23.83 
 
 		 554 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 673 aa  82  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0150  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.36 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1030  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.36 
 
 		 617 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  27.8 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 615 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 615 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0448  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  23.5 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.2 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  24.8 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  24.8 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  27.44 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  22.27 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.8 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  34.46 
 
 		 548 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  34.46 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  27.11 
 
 		 624 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  24.43 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  29.88 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  22.81 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  23.38 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.19 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>