More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0082 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 419 aa  858    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  71.36 
 
 		 422 aa  619  1e-176  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  69.45 
 
 		 422 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  61.18 
 
 		 428 aa  498  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  57.65 
 
 		 428 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  57.18 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  57.01 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  59.71 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  57.41 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  57.41 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  57.41 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  57.41 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  57.41 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  57.18 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  57.21 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  57.41 
 
 		 428 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  57.32 
 
 		 423 aa  481  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  57.7 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  57.7 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  56.5 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  48.71 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  47.2 
 
 		 435 aa  363  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  44.71 
 
 		 447 aa  355  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  43.66 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  44.6 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  43.16 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  43.02 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  42.62 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  44.37 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  44.85 
 
 		 441 aa  339  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  43.4 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  42 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  42.65 
 
 		 432 aa  335  7.999999999999999e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 410 aa  335  1e-90  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  41.19 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  40.9 
 
 		 448 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  42.69 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  43.55 
 
 		 441 aa  330  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  42.08 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  42.41 
 
 		 731 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  40.43 
 
 		 415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  42.48 
 
 		 461 aa  325  9e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  43.96 
 
 		 456 aa  323  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  44.39 
 
 		 463 aa  322  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  41.09 
 
 		 420 aa  322  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  42.16 
 
 		 412 aa  319  5e-86  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf175  recombination factor protein RarA  42.51 
 
 		 402 aa  319  5e-86  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  39.81 
 
 		 441 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  40.24 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  43.56 
 
 		 445 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  43.84 
 
 		 441 aa  315  7e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  43.56 
 
 		 445 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  41.39 
 
 		 428 aa  315  7e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  43.03 
 
 		 458 aa  315  8e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  43.56 
 
 		 445 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  41.69 
 
 		 434 aa  315  9e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  39.62 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  42.79 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  42.89 
 
 		 739 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  41.71 
 
 		 726 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  40.38 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  40.09 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0186  recombination factor protein RarA  39.7 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  43.49 
 
 		 735 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  42.86 
 
 		 447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  42.12 
 
 		 494 aa  311  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  41.77 
 
 		 505 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  41.87 
 
 		 456 aa  309  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  39.59 
 
 		 519 aa  306  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  41.45 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  39.76 
 
 		 451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  40.49 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  38.85 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  38.77 
 
 		 434 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  40.8 
 
 		 426 aa  302  6.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  38.68 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  42.38 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  40.43 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  40.28 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  40.24 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  39.43 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.85 
 
 		 721 aa  300  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  40.84 
 
 		 456 aa  299  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  41.19 
 
 		 436 aa  299  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  39.95 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  39.24 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  39.16 
 
 		 431 aa  296  6e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  40.45 
 
 		 432 aa  296  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  43.1 
 
 		 457 aa  295  7e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  41.83 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  41.57 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  41.87 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.29 
 
 		 733 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  40.19 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  41.27 
 
 		 465 aa  293  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  41.94 
 
 		 460 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05617  DNA replication ATPase (Eurofung)  41.06 
 
 		 528 aa  293  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00143305  normal  0.0551147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>