More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0048 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
472 aa  950    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.55 
 
 
473 aa  692    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.13 
 
 
469 aa  656    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.97 
 
 
470 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.33 
 
 
470 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.01 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.01 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.01 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.01 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.01 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.01 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.8 
 
 
470 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.16 
 
 
470 aa  511  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.8 
 
 
470 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.8 
 
 
470 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.3 
 
 
468 aa  511  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.3 
 
 
468 aa  511  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.43 
 
 
470 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.66 
 
 
468 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.31 
 
 
475 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.84 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.34 
 
 
459 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
475 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.41 
 
 
593 aa  359  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 
625 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.41 
 
 
602 aa  353  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.8 
 
 
607 aa  352  8e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 
616 aa  350  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.71 
 
 
603 aa  350  3e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 
603 aa  348  8e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 
465 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 
481 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
467 aa  348  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  42 
 
 
599 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 
474 aa  346  5e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  42.03 
 
 
474 aa  346  6e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.21 
 
 
579 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.2 
 
 
464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 
594 aa  343  5e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.28 
 
 
491 aa  342  9e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
465 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  42 
 
 
619 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.65 
 
 
588 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.73 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 
492 aa  339  5e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 
484 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  42.86 
 
 
466 aa  338  9e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.4 
 
 
463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.2 
 
 
484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.99 
 
 
484 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.68 
 
 
594 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
462 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.42 
 
 
475 aa  335  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.47 
 
 
466 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0440  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.42 
 
 
591 aa  333  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.46872  normal  0.0861409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.01 
 
 
685 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 
464 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 
462 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
463 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 
466 aa  329  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
589 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
589 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
589 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
589 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  41.19 
 
 
468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2665  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
589 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 
465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.44 
 
 
600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.87 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
464 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
589 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1988  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
475 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2743  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
589 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.23 
 
 
603 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110052  normal  0.0211512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.88 
 
 
476 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3002  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 
473 aa  326  7e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
464 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5611  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 
573 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
589 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.4 
 
 
467 aa  325  9e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.67 
 
 
476 aa  325  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
463 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
464 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  41.03 
 
 
474 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
462 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.31 
 
 
463 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
463 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.4 
 
 
467 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.31 
 
 
463 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  41.03 
 
 
474 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 
469 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.99 
 
 
593 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
463 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
462 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.37 
 
 
480 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 
474 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
463 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.66 
 
 
464 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>