More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0018 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  53.16 
 
 		 700 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  53.58 
 
 		 633 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  61.62 
 
 		 658 aa  743    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  53.58 
 
 		 633 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  53.58 
 
 		 633 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  53.58 
 
 		 633 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.91 
 
 		 697 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.31 
 
 		 632 aa  646    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.62 
 
 		 635 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.61 
 
 		 702 aa  701    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0072472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.81 
 
 		 639 aa  660    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  53.49 
 
 		 633 aa  647    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  53.58 
 
 		 633 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.49 
 
 		 633 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  53.58 
 
 		 633 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  100 
 
 		 695 aa  1420    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0188  ATP-dependent Zn protease  59.47 
 
 		 734 aa  649    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  58.21 
 
 		 708 aa  717    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  60.28 
 
 		 655 aa  733    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.91 
 
 		 697 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  53.58 
 
 		 633 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  53.65 
 
 		 633 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0404  ATP-dependent Zn protease  56.12 
 
 		 700 aa  629  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.083977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.45 
 
 		 611 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.44 
 
 		 602 aa  599  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.03 
 
 		 615 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.76 
 
 		 639 aa  591  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.6 
 
 		 630 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.81 
 
 		 643 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  47.3 
 
 		 616 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.28 
 
 		 601 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.28 
 
 		 601 aa  582  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  48.65 
 
 		 638 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  58.22 
 
 		 654 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.67 
 
 		 614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.21 
 
 		 637 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  47.38 
 
 		 647 aa  573  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  47.38 
 
 		 650 aa  572  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  49.68 
 
 		 627 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.3 
 
 		 652 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.01 
 
 		 657 aa  571  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  58.13 
 
 		 693 aa  569  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.35 
 
 		 612 aa  571  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.8 
 
 		 759 aa  570  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.66 
 
 		 612 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.12 
 
 		 610 aa  566  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.68 
 
 		 687 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.57 
 
 		 640 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  49.12 
 
 		 665 aa  567  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.41 
 
 		 653 aa  567  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  49.05 
 
 		 613 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.08 
 
 		 676 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.64 
 
 		 783 aa  567  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.12 
 
 		 610 aa  567  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.57 
 
 		 638 aa  567  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.44 
 
 		 684 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  53.59 
 
 		 682 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.57 
 
 		 636 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  46.83 
 
 		 764 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.55 
 
 		 607 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.12 
 
 		 679 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.6 
 
 		 660 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.13 
 
 		 750 aa  560  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 608 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  46.36 
 
 		 641 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.39 
 
 		 639 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.91 
 
 		 682 aa  561  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.8 
 
 		 645 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  47.85 
 
 		 612 aa  559  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  47.9 
 
 		 613 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.75 
 
 		 620 aa  561  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.63 
 
 		 621 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.5 
 
 		 635 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.91 
 
 		 753 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  48.55 
 
 		 639 aa  558  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  48.55 
 
 		 639 aa  558  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  47.57 
 
 		 626 aa  558  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.27 
 
 		 672 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  46.32 
 
 		 639 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.44 
 
 		 608 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.96 
 
 		 669 aa  557  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.32 
 
 		 639 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.81 
 
 		 612 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.63 
 
 		 638 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  48.97 
 
 		 617 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  48.87 
 
 		 639 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  53.54 
 
 		 689 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  47.99 
 
 		 658 aa  558  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  48.15 
 
 		 641 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.14 
 
 		 671 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.15 
 
 		 641 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.41 
 
 		 640 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.02 
 
 		 672 aa  555  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.82 
 
 		 640 aa  552  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  45.37 
 
 		 651 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 644 aa  554  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.82 
 
 		 631 aa  554  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.58 
 
 		 640 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  45.93 
 
 		 659 aa  555  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  46.32 
 
 		 641 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>