213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0008 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  210  5.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  45.83 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  36.7 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  45.12 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  38.68 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  39.62 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  44.44 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 
196 aa  73.6  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  43.9 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  43.9 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  43.9 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  51.32 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  43.04 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  39 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  45.59 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  39.24 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  49.21 
 
 
459 aa  67  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40.23 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  49.28 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  49.28 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  35.58 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 
334 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
273 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  50.94 
 
 
262 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  50.94 
 
 
262 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 
262 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  50.94 
 
 
262 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
312 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 
338 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  47.27 
 
 
362 aa  61.6  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
205 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  34.48 
 
 
200 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  48.33 
 
 
296 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
364 aa  60.1  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  46.67 
 
 
293 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
320 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  40.85 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  40.85 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 
203 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  39.44 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  39.44 
 
 
374 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
327 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  40.85 
 
 
374 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
322 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  39.44 
 
 
374 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  43.08 
 
 
328 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
197 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
204 aa  55.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
242 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  37.97 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 
197 aa  54.7  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  42.03 
 
 
374 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  40.74 
 
 
272 aa  54.7  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  42.03 
 
 
374 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
206 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
178 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 
395 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
368 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  45.76 
 
 
240 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  37.68 
 
 
233 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  37.68 
 
 
233 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  33.33 
 
 
244 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  34.92 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  37.68 
 
 
233 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.33 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1674  hypothetical protein  36.23 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
277 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1657  hypothetical protein  36.23 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  33.33 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
247 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1855  DNA-binding protein  36.23 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.18378e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  32.43 
 
 
358 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  35.38 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  35.38 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  35.38 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  33.33 
 
 
210 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15930  predicted transcriptional regulator  40.68 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000543618  hitchhiker  0.000000237472 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  0.0000852105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
374 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  47.83 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  43.55 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
206 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 
210 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>