More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
359 aa  732    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  70.3 
 
 
346 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  69.97 
 
 
330 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  71.99 
 
 
340 aa  457  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  69.68 
 
 
310 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  67.9 
 
 
333 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  69.62 
 
 
332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  72.82 
 
 
344 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  70.34 
 
 
329 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  68.52 
 
 
319 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  70.16 
 
 
310 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  67.65 
 
 
313 aa  430  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  67.21 
 
 
310 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  63.29 
 
 
353 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  68.85 
 
 
309 aa  421  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  65.05 
 
 
310 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  72.13 
 
 
327 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  66.35 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  63.19 
 
 
318 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  65.73 
 
 
348 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  66.35 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  66.35 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  62.54 
 
 
318 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  61.85 
 
 
348 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  65.79 
 
 
331 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  64.59 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  65.19 
 
 
325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  64.17 
 
 
329 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  66.78 
 
 
336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  65.15 
 
 
317 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  63.49 
 
 
335 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  59.63 
 
 
333 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  64.05 
 
 
331 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  62.38 
 
 
361 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  62.3 
 
 
330 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  63.81 
 
 
317 aa  381  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  63.81 
 
 
362 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  62.01 
 
 
327 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  61.94 
 
 
325 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  56.17 
 
 
313 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  59.34 
 
 
318 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  57.05 
 
 
325 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  57.14 
 
 
325 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  58.01 
 
 
320 aa  346  3e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  54.13 
 
 
334 aa  345  8e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  55.49 
 
 
325 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  55.96 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  55.63 
 
 
314 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  53.59 
 
 
319 aa  333  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  53.55 
 
 
311 aa  330  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  49.25 
 
 
339 aa  329  4e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  52.41 
 
 
334 aa  327  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  52.79 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  51.47 
 
 
311 aa  325  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  51.78 
 
 
456 aa  325  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  54.1 
 
 
345 aa  325  9e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  55.96 
 
 
314 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  51.29 
 
 
311 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  52.27 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  48.04 
 
 
460 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  51.6 
 
 
311 aa  319  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  54.28 
 
 
312 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  54.28 
 
 
317 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  53.62 
 
 
321 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  51.29 
 
 
461 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  51.29 
 
 
461 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
331 aa  317  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
311 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  50.31 
 
 
335 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  53.62 
 
 
321 aa  315  9e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
314 aa  315  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  55.23 
 
 
320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.62 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
332 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  47.84 
 
 
453 aa  311  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  51.3 
 
 
309 aa  309  5.9999999999999995e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
326 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  49.55 
 
 
458 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  47.39 
 
 
315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  46.57 
 
 
342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
324 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  54.1 
 
 
321 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  53.11 
 
 
314 aa  306  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
320 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  48.96 
 
 
460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  51.8 
 
 
313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
323 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  46.43 
 
 
361 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  50.48 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  50.98 
 
 
321 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  49.7 
 
 
547 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
322 aa  302  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  48.72 
 
 
313 aa  301  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  48.09 
 
 
320 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  53.44 
 
 
321 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  48.09 
 
 
320 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  52.79 
 
 
314 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>