More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  100 
 
 
189 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  61.58 
 
 
177 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  58.25 
 
 
188 aa  209  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  80.33 
 
 
182 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  62.11 
 
 
166 aa  206  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  65.28 
 
 
173 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  78.05 
 
 
189 aa  204  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  77.87 
 
 
159 aa  204  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  64.21 
 
 
175 aa  203  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  77.24 
 
 
170 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  58.95 
 
 
300 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  77.24 
 
 
192 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  76.23 
 
 
198 aa  200  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  66.88 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  59.69 
 
 
178 aa  198  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  75.41 
 
 
219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  76.23 
 
 
193 aa  197  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  75.41 
 
 
186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  75.41 
 
 
200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  57.37 
 
 
164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  58.95 
 
 
165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  76.23 
 
 
193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  73.81 
 
 
166 aa  194  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  75.63 
 
 
172 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  75.63 
 
 
172 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  75.63 
 
 
172 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  65.1 
 
 
188 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  71.31 
 
 
168 aa  188  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  52.63 
 
 
153 aa  186  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  69.4 
 
 
218 aa  184  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  69.67 
 
 
195 aa  184  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  58.95 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  67.48 
 
 
167 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  67.48 
 
 
169 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  74.55 
 
 
171 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  53.68 
 
 
163 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  65.62 
 
 
171 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  56.21 
 
 
170 aa  174  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  71.31 
 
 
182 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  57.58 
 
 
179 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  62.88 
 
 
193 aa  170  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  65.29 
 
 
191 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  63.71 
 
 
179 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  49.07 
 
 
167 aa  154  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  61.79 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  49.58 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  48.36 
 
 
225 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  51.69 
 
 
179 aa  121  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  45.08 
 
 
305 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  47.11 
 
 
148 aa  109  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  39.34 
 
 
233 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  40.17 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  39.24 
 
 
164 aa  94.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  36.53 
 
 
173 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  36.53 
 
 
173 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  36.53 
 
 
173 aa  88.2  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  36.53 
 
 
172 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  36.53 
 
 
173 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  36.53 
 
 
172 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  36.88 
 
 
164 aa  87.8  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  36.97 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  37.27 
 
 
164 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  35.93 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  35.93 
 
 
173 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 
169 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 
170 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  36.13 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  37.31 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  41.9 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  41.9 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  40 
 
 
136 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  35.71 
 
 
137 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  39.62 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  42.45 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  39.62 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  36.6 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  36.36 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  35.34 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  38 
 
 
125 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  33.1 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  38 
 
 
125 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  37.38 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  34.41 
 
 
172 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  40.74 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  35.95 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  38 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.284268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>