19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25630  alkylmercury lyase  100 
 
 
227 aa  456  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3214  alkylmercury lyase  60.65 
 
 
213 aa  241  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00854121  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4512  alkylmercury lyase  55.17 
 
 
221 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0148177 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0164  alkylmercury lyase  42.93 
 
 
212 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.581292  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02948  alkylmercury lyase  41.26 
 
 
211 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0319  alkylmercury lyase  40.64 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5374  Alkylmercury lyase  42.61 
 
 
216 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0243  alkylmercury lyase  41.79 
 
 
211 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2647  Alkylmercury lyase  46.59 
 
 
213 aa  144  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2330  alkylmercury lyase  30.68 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0726495  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1769  alkylmercury lyase  31.54 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5375  alkylmercury lyase  30.34 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0322  hypothetical protein  37.8 
 
 
100 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4942  alkylmercury lyase  25.66 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0286842  normal  0.02099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  29.28 
 
 
767 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2197  alkylmercury lyase  28.57 
 
 
317 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  30.15 
 
 
767 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  30.33 
 
 
745 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1768  alkylmercury lyase  32.2 
 
 
190 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.628119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>