More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  403  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  33.73 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  31.98 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  33.52 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  30.46 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 183 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 308 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  42.62 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  25.68 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  34.83 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  25.68 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  26.88 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>