More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25450 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 
817 aa  1659    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  38.6 
 
 
784 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  38.46 
 
 
821 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 
820 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  37.25 
 
 
833 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  38.35 
 
 
807 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  35.84 
 
 
773 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  38.35 
 
 
892 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.53 
 
 
763 aa  395  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  37.32 
 
 
765 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
807 aa  396  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  35.14 
 
 
801 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  35.7 
 
 
789 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.31 
 
 
821 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  35.84 
 
 
739 aa  362  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  33.7 
 
 
727 aa  360  8e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  33.29 
 
 
766 aa  359  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  35.36 
 
 
819 aa  355  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  35.26 
 
 
723 aa  350  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  34.56 
 
 
838 aa  350  8e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  33.19 
 
 
740 aa  342  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  32.37 
 
 
772 aa  336  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  33.43 
 
 
744 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  35.77 
 
 
880 aa  335  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.93 
 
 
737 aa  335  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.48 
 
 
727 aa  331  3e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  34.61 
 
 
871 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  31.28 
 
 
773 aa  319  1e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  36.21 
 
 
1057 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 
747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  35.31 
 
 
758 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
801 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  31.02 
 
 
768 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
758 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
808 aa  304  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.2 
 
 
736 aa  304  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  33.07 
 
 
771 aa  303  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 
766 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
877 aa  301  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  33.07 
 
 
830 aa  299  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  34.76 
 
 
726 aa  297  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.38 
 
 
695 aa  296  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
705 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 
759 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  34.76 
 
 
814 aa  294  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  31.94 
 
 
721 aa  293  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  35.85 
 
 
680 aa  289  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
824 aa  283  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
830 aa  281  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  31.83 
 
 
810 aa  280  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  32.55 
 
 
710 aa  280  7e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  31.72 
 
 
722 aa  278  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
831 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
831 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.03 
 
 
723 aa  276  8e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
828 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  33.29 
 
 
693 aa  269  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 
816 aa  268  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
816 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
816 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
816 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.11 
 
 
720 aa  266  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
817 aa  266  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  31.26 
 
 
818 aa  264  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  31.67 
 
 
710 aa  259  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  30.93 
 
 
750 aa  257  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  30.44 
 
 
710 aa  254  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.64 
 
 
761 aa  253  9.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
710 aa  253  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.99 
 
 
840 aa  243  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  31.38 
 
 
905 aa  242  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
700 aa  237  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
806 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
806 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
806 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  30.24 
 
 
825 aa  232  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 
761 aa  232  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
703 aa  231  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  29.07 
 
 
649 aa  231  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
725 aa  228  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.64 
 
 
661 aa  227  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  29.78 
 
 
808 aa  226  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  31.84 
 
 
836 aa  224  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  28.34 
 
 
648 aa  224  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  30.13 
 
 
821 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  28.69 
 
 
668 aa  220  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  29.05 
 
 
751 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  28.66 
 
 
640 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.9 
 
 
806 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  29.17 
 
 
833 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  27.87 
 
 
796 aa  213  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  30.24 
 
 
732 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  28.45 
 
 
770 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  29.16 
 
 
727 aa  211  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.11 
 
 
648 aa  211  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  29 
 
 
811 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  30.97 
 
 
712 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.11 
 
 
859 aa  209  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  27.36 
 
 
676 aa  208  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  27.14 
 
 
880 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>