248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24710 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
255 aa  503  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
253 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  44.08 
 
 
167 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
175 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 
169 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
156 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  36 
 
 
162 aa  82  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  49.41 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  45.98 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  34 
 
 
169 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  35.48 
 
 
175 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  35.24 
 
 
157 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
167 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
157 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
154 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  32.14 
 
 
160 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
156 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
151 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  27.01 
 
 
160 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
145 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
145 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  31.43 
 
 
160 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  31.43 
 
 
160 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
135 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
157 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
135 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
133 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  31.13 
 
 
163 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
157 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  32.62 
 
 
158 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  32.77 
 
 
149 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
155 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
143 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
145 aa  52.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 
153 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  34.57 
 
 
135 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
156 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
171 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  30.71 
 
 
160 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  30.71 
 
 
160 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  30.71 
 
 
160 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  30.71 
 
 
157 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  40.85 
 
 
212 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 
153 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
140 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  35.04 
 
 
155 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  32.58 
 
 
149 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 
150 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
142 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
175 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  30.33 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
152 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
135 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
148 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  28.81 
 
 
153 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  30.33 
 
 
134 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
158 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  40.79 
 
 
329 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  40.32 
 
 
167 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
134 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  40.79 
 
 
329 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
149 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
153 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  45 
 
 
138 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  29.51 
 
 
164 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
163 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
155 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
155 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
155 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.21 
 
 
163 aa  48.9  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.57 
 
 
135 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.43 
 
 
135 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
135 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.43 
 
 
135 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  34.52 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 
153 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  29.66 
 
 
153 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.43 
 
 
135 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 
169 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.43 
 
 
135 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  38.1 
 
 
163 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  26.52 
 
 
153 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  31.71 
 
 
144 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
130 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  38.16 
 
 
138 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  41.67 
 
 
137 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 
170 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>