175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24440 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24440  K+ transport system, NAD-binding component  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.800738  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  56.54 
 
 
221 aa  244  6.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  53.18 
 
 
235 aa  228  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  54.5 
 
 
225 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  52.09 
 
 
232 aa  218  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  53.02 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  49.77 
 
 
254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  52.13 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  48.42 
 
 
228 aa  208  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  49.07 
 
 
228 aa  208  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  47.62 
 
 
213 aa  198  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  48.57 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  49.3 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  45 
 
 
223 aa  191  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  46.95 
 
 
220 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  45.87 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  43.58 
 
 
224 aa  187  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  46.82 
 
 
224 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  44.71 
 
 
222 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  43.87 
 
 
231 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  44.29 
 
 
222 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  43.06 
 
 
220 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  41.71 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  41.51 
 
 
230 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  43.81 
 
 
225 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  41.15 
 
 
222 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  40.19 
 
 
222 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  38.55 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  38.55 
 
 
221 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  39.89 
 
 
215 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  35.89 
 
 
231 aa  128  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  37.32 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  38.29 
 
 
215 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  34.93 
 
 
229 aa  123  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  38.76 
 
 
221 aa  123  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  34.29 
 
 
233 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  34.45 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  33.33 
 
 
232 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  34.93 
 
 
227 aa  118  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  34.97 
 
 
219 aa  116  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  33.17 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  36.11 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  33.97 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  33.01 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  30.95 
 
 
220 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  32.21 
 
 
223 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 
220 aa  111  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 
220 aa  111  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  37.36 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3550  hypothetical protein  36.99 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 
229 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  32.06 
 
 
250 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 
229 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  34.8 
 
 
222 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  34.27 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  33.71 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  33.71 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  33.71 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  33.71 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  33.71 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  33.71 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  33.71 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  33.71 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  33.71 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  33.71 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  32.06 
 
 
233 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  35.26 
 
 
222 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  28.43 
 
 
217 aa  105  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  32.23 
 
 
218 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  32.22 
 
 
217 aa  101  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
227 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  33.9 
 
 
217 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  32.43 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  31.11 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
217 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  30.62 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  31.66 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  31.64 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  29.77 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  34.25 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  31.93 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  31.03 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  31.87 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  32.21 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  27.01 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  27.64 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  32.5 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 
232 aa  88.6  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0519  TrkA-N domain protein  30.62 
 
 
225 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.416454  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  27.96 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0054  TrkA-N domain protein  31.51 
 
 
232 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 
232 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4304  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 
232 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.333456  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  35.96 
 
 
224 aa  85.5  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>