More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24200 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  72.71 
 
 
438 aa  645    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  72.48 
 
 
438 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  100 
 
 
435 aa  879    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  100 
 
 
435 aa  879    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  100 
 
 
435 aa  879    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  99.08 
 
 
435 aa  869    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  70.8 
 
 
438 aa  635    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  72.71 
 
 
438 aa  645    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  70.8 
 
 
438 aa  635    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  99.08 
 
 
435 aa  869    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  72.12 
 
 
436 aa  641    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  73.83 
 
 
442 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  100 
 
 
435 aa  879    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  72.71 
 
 
438 aa  644    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  100 
 
 
435 aa  879    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  71.1 
 
 
438 aa  631  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  71.76 
 
 
451 aa  634  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  71.26 
 
 
443 aa  626  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  71.26 
 
 
443 aa  626  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  70.79 
 
 
450 aa  613  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  69.82 
 
 
435 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  69.82 
 
 
435 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  70.79 
 
 
450 aa  613  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06900  transposase family protein  65.82 
 
 
436 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0445695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22440  transposase family protein  65.82 
 
 
436 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0283397  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  70.74 
 
 
378 aa  541  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1877  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.493303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3018  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2168  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00169456  hitchhiker  0.0053123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1941  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.527296  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397889  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2260  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1027  normal  0.0456513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1169  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0217925  normal  0.194588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4491  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0776  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688226  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0427  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0439  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  60.6 
 
 
433 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.741864  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  71.93 
 
 
346 aa  509  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  66.95 
 
 
362 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  71.61 
 
 
311 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50.12 
 
 
436 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50.12 
 
 
436 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50.12 
 
 
436 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.34 
 
 
438 aa  341  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22400  transposase family protein  37.56 
 
 
454 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.323222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23490  transposase family protein  37.56 
 
 
454 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05360  transposase family protein  37.56 
 
 
454 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.711648  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.94 
 
 
434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135033  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1245  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.94 
 
 
434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139986  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2889  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.94 
 
 
434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124927  hitchhiker  0.00109872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3047  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.94 
 
 
434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000291896  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0990  transposase  52.7 
 
 
177 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.34 
 
 
439 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0461  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.34 
 
 
439 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1765  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.34 
 
 
439 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00126506  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.34 
 
 
439 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415277  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2910  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.34 
 
 
439 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000150171  hitchhiker  0.0000194691 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  29.47 
 
 
407 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  29.47 
 
 
407 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  29.47 
 
 
407 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  29.47 
 
 
457 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.34 
 
 
439 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.34 
 
 
440 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0906  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.34 
 
 
440 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4069  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.34 
 
 
442 aa  103  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.414136 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  29.64 
 
 
428 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  29.64 
 
 
428 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  29.29 
 
 
428 aa  97.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1174  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.41 
 
 
408 aa  96.7  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000815795  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0599  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.41 
 
 
408 aa  96.7  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14350  transposase  30.39 
 
 
350 aa  96.3  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10230  transposase  30.39 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14300  transposase  30.39 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381187  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04670  transposase  30.39 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.86 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00450  transposase  30.39 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03140  transposase  30.39 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04880  transposase  30.39 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.41 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.520122  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.41 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0551  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.41 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.340213  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.41 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.468712  normal  0.0451791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.41 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0373  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.15 
 
 
408 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384224  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1177  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.41 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123826  normal  0.601968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2780  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.36 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0010  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.36 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0556  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.36 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0341  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.9 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.717183  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0371  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.14 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2871  transposase  26.55 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0586611  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4482  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.46 
 
 
408 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3509  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.46 
 
 
408 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4034  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.46 
 
 
408 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1816  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.46 
 
 
408 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2977  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.22 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12824  transposase  49.47 
 
 
132 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000191598  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0803  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.98 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>