151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23950 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23950  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0625654  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14014  tRNA-Arg  93.15 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0046  tRNA-Arg  91.78 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.455447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0043  tRNA-Arg  91.78 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924826  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0048  tRNA-Arg  91.78 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358997  normal  0.0149613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0043  tRNA-Arg  91.78 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15231  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0018  tRNA-Arg  91.78 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390267  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0022  tRNA-Arg  92.42 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0054  tRNA-Arg  91.18 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0076  tRNA-Arg  90 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0050  tRNA-Arg  90.77 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.679099  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0008  tRNA-Arg  89.71 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02560  tRNA-Arg  88.73 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.574761  hitchhiker  0.000017399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30020  tRNA-Arg  87.5 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00306954  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27110  tRNA-Arg  87.32 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0020  tRNA-Arg  97.06 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.979271  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0415114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.780721  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198165  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11730  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827241  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00361303  normal  0.0286488 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0069  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0263257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32790  tRNA-Arg  86.11 
 
 
76 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0011  tRNA-Arg  96.88 
 
 
76 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0506396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0030  tRNA-Arg  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.474637  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0028  tRNA-Arg  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14018  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0060  tRNA-Arg  85.92 
 
 
76 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.530052  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07940  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00762126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  54  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 
72 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.428212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0009  tRNA-Arg  96.67 
 
 
73 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000808777  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 
72 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0798603  decreased coverage  0.00114239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.99617  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0033  tRNA-Arg  96.67 
 
 
77 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 
72 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0011  tRNA-Arg  96.67 
 
 
73 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486376  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 
72 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198977  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24430  tRNA-Arg  86.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257328  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18410  tRNA-Arg  100 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0950297  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0043  tRNA-Val  85.25 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000221825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0048  tRNA-Arg  96.55 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00910953  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0043  tRNA-Val  85.25 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.174816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0017  tRNA-Arg  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0801926 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.226409  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0045  tRNA-Arg  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0128095  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0051  tRNA-Arg  84.72 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.23821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151392  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.826255  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00106807  normal  0.150294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399679  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000104257  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00889349  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0297  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000682634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0563  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0113  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000284792  normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000357369  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000331563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191091  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000223271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.173702  normal  0.696884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0065  tRNA-Arg  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0022  tRNA-Arg  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00454117  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000965131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000747728  normal  0.0921402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>