More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23510 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  277  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  43.7 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 190 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 198 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 255 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3639  putative transcriptional regulator, MerR family  45.79 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  44.04 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  41.23 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 201 aa  90.5  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2478  transcriptional regulator, MerR family  54.05 
 
 		 185 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.263723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  39.29 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  40.74 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  47.25 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2084  transcriptional regulator, MerR family  54.05 
 
 		 191 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  43.86 
 
 		 449 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  41.74 
 
 		 491 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  50.51 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  41 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  41 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  41 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  38.02 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  34.26 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  41.58 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  41.41 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0836  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  40.79 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  29.51 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  37.82 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2312  putative transcriptional regulator, MerR family  35.11 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  27.87 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  37.04 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  29.75 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  39.8 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  31.63 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>