218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23230 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  100 
 
 
415 aa  788    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  44.54 
 
 
448 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  45.8 
 
 
418 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  42.76 
 
 
423 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  42.04 
 
 
451 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.69 
 
 
464 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  32.33 
 
 
468 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  38.76 
 
 
407 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  40.56 
 
 
413 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  40.14 
 
 
413 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  35.41 
 
 
433 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  38.48 
 
 
394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  40.99 
 
 
414 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  37.1 
 
 
436 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  36.15 
 
 
420 aa  157  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  34.36 
 
 
426 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  34.5 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  34.92 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  35.21 
 
 
433 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  38.27 
 
 
418 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  33.04 
 
 
437 aa  136  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  34.65 
 
 
410 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  32.38 
 
 
455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  32.26 
 
 
431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  30.96 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  33.57 
 
 
418 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  28.38 
 
 
428 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  28.77 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  30.41 
 
 
427 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  34.23 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.55 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  47.37 
 
 
456 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  55 
 
 
462 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  52.63 
 
 
456 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  39.76 
 
 
359 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  28 
 
 
503 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  59.62 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  51.92 
 
 
495 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  51.92 
 
 
495 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  41.98 
 
 
465 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  43.48 
 
 
469 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 
354 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  29.76 
 
 
545 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 
346 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  41.67 
 
 
419 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  36 
 
 
459 aa  53.5  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  51.85 
 
 
537 aa  53.1  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  50.85 
 
 
338 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  56 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  46.38 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  49.21 
 
 
589 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  44.59 
 
 
465 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  53.85 
 
 
436 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  50 
 
 
463 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  51.67 
 
 
463 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
330 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  49.21 
 
 
444 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.18 
 
 
478 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  61.9 
 
 
492 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.18 
 
 
478 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 
520 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  50 
 
 
490 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 
520 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 
520 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  51.85 
 
 
460 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  48.08 
 
 
487 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  48.08 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  50.98 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  48.08 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  48.08 
 
 
485 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  48.08 
 
 
482 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  45.1 
 
 
245 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  43.94 
 
 
949 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  48.08 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  46.88 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  38.46 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  35.53 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  48.08 
 
 
490 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  38.46 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  45.61 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  27.4 
 
 
492 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  48.08 
 
 
487 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  40.22 
 
 
506 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  27.68 
 
 
492 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  27.36 
 
 
548 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  41.43 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  48.08 
 
 
487 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  41.43 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  43.08 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  56.1 
 
 
628 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  44.05 
 
 
502 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  27.67 
 
 
498 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  42.65 
 
 
843 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  39.13 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 
510 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  37.36 
 
 
447 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  27.67 
 
 
498 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  47.06 
 
 
484 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 
528 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>