61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22870 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  724    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  70.44 
 
 
367 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  46.03 
 
 
366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  46.47 
 
 
367 aa  323  4e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  46.45 
 
 
367 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  45.61 
 
 
362 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  44.54 
 
 
360 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  43.82 
 
 
366 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  42.9 
 
 
369 aa  285  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  44.97 
 
 
361 aa  282  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  43.49 
 
 
365 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  41.64 
 
 
374 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  48.31 
 
 
355 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  44.29 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  46.02 
 
 
362 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  48.86 
 
 
362 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  39.89 
 
 
369 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  46.67 
 
 
362 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  44.03 
 
 
366 aa  262  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  40.43 
 
 
369 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  42.54 
 
 
374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  41.3 
 
 
360 aa  248  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  44.38 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  40.64 
 
 
372 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  36.16 
 
 
371 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  37.68 
 
 
367 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  38.94 
 
 
367 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  41.87 
 
 
356 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  41.62 
 
 
375 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  33.85 
 
 
371 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  30.67 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  32.09 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  34.12 
 
 
348 aa  170  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  34.1 
 
 
357 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  32.63 
 
 
983 aa  163  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  32.51 
 
 
354 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  33.43 
 
 
390 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  39.28 
 
 
381 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  29.59 
 
 
373 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  34.93 
 
 
358 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  30.73 
 
 
999 aa  142  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  29.89 
 
 
372 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  32.68 
 
 
370 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  31.2 
 
 
994 aa  139  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  29.32 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  32.73 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  30.33 
 
 
405 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  25.57 
 
 
363 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  29.36 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  31.58 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  26.79 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  24.58 
 
 
354 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  28.16 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  24.73 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  24.45 
 
 
376 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  24.45 
 
 
363 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  27.14 
 
 
365 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  26.46 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  26.47 
 
 
365 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  26.7 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3516  hypothetical protein  27.39 
 
 
363 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>