27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22770 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  606  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22570  hypothetical protein  65.04 
 
 
237 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  40.36 
 
 
207 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4917  hypothetical protein  29.9 
 
 
224 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  31.15 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25030  hypothetical protein  27.98 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3085  hypothetical protein  24.26 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5471  hypothetical protein  30.95 
 
 
230 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.927371  normal  0.730632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3281  hypothetical protein  35.66 
 
 
192 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  27.05 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1071  hypothetical protein  36.17 
 
 
192 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1712  hypothetical protein  35.06 
 
 
237 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  31.29 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  32.68 
 
 
279 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  28.72 
 
 
306 aa  49.3  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  24.74 
 
 
195 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  33.78 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  34.16 
 
 
270 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  31.43 
 
 
205 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2517  hypothetical protein  35.2 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  28.68 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3053  hypothetical protein  27.81 
 
 
196 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.634225  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  22.97 
 
 
201 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  24.74 
 
 
195 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  31.33 
 
 
331 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  30.97 
 
 
205 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2365  hypothetical protein  37.08 
 
 
175 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.336126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>