206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21590 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  72.76 
 
 
548 aa  771    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  71.35 
 
 
550 aa  767    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  75.14 
 
 
558 aa  836    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  75 
 
 
555 aa  800    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  72.64 
 
 
561 aa  796    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  72.09 
 
 
545 aa  775    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  72.09 
 
 
551 aa  785    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  73.01 
 
 
548 aa  789    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  70.87 
 
 
548 aa  789    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  71.9 
 
 
549 aa  755    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  73.2 
 
 
554 aa  803    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  75.09 
 
 
548 aa  819    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  71.53 
 
 
551 aa  788    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  100 
 
 
550 aa  1112    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  74.35 
 
 
546 aa  805    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  71.9 
 
 
549 aa  755    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  73.2 
 
 
549 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  76.89 
 
 
548 aa  846    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  73.2 
 
 
555 aa  775    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  71.9 
 
 
549 aa  755    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  72.64 
 
 
549 aa  761    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  70.75 
 
 
581 aa  774    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  74.59 
 
 
556 aa  786    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  74.13 
 
 
558 aa  834    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  70.39 
 
 
542 aa  735    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  70.98 
 
 
549 aa  786    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  73.54 
 
 
557 aa  792    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  73.75 
 
 
550 aa  797    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  75.18 
 
 
558 aa  832    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  71.16 
 
 
548 aa  781    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  72.83 
 
 
545 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  73.75 
 
 
548 aa  806    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  70.93 
 
 
559 aa  779    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  55.08 
 
 
602 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  45.83 
 
 
590 aa  515  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  43.94 
 
 
564 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  29.71 
 
 
838 aa  275  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  34.94 
 
 
666 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  31.11 
 
 
781 aa  269  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  30.92 
 
 
818 aa  263  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  38.48 
 
 
630 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  36.19 
 
 
658 aa  252  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  36.13 
 
 
720 aa  251  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  35.67 
 
 
649 aa  250  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  36.53 
 
 
866 aa  243  9e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  33.08 
 
 
551 aa  183  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  34.54 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  33.76 
 
 
444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  30.56 
 
 
531 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  31.38 
 
 
462 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  32.74 
 
 
652 aa  156  9e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  33.69 
 
 
650 aa  156  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  31.87 
 
 
468 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  32.2 
 
 
499 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  30.83 
 
 
488 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  32.21 
 
 
494 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  31.77 
 
 
449 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  30.75 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  31.67 
 
 
654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  31.3 
 
 
440 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  32.58 
 
 
647 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  33.1 
 
 
479 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 
466 aa  144  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  30.83 
 
 
517 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  29.2 
 
 
590 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  29.2 
 
 
466 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  31.86 
 
 
470 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  32.3 
 
 
509 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  32.3 
 
 
509 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.98 
 
 
444 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 
479 aa  131  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  29.15 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  29.12 
 
 
456 aa  128  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  28.98 
 
 
443 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  27.78 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  28.77 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  28.77 
 
 
479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  26.94 
 
 
630 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  28.23 
 
 
479 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  27.84 
 
 
479 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  28.35 
 
 
451 aa  108  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  28.13 
 
 
451 aa  106  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  29.04 
 
 
485 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  28.73 
 
 
485 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  27.08 
 
 
463 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  35.06 
 
 
796 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  32.11 
 
 
886 aa  89.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  25 
 
 
998 aa  87.4  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.68 
 
 
633 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  23.98 
 
 
905 aa  81.6  0.00000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  25.89 
 
 
920 aa  79  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  27.59 
 
 
809 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  27.59 
 
 
809 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  33.13 
 
 
778 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  27.01 
 
 
796 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  27.2 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  31.58 
 
 
925 aa  77.4  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  27.61 
 
 
786 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  27.46 
 
 
951 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  28.77 
 
 
784 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>