More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21430 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  100 
 
 
465 aa  899    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  46.29 
 
 
469 aa  323  5e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  46.82 
 
 
428 aa  317  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  46.77 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  48.72 
 
 
447 aa  300  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  46.28 
 
 
409 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  47.73 
 
 
412 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  42.68 
 
 
415 aa  289  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  46.65 
 
 
424 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  44.42 
 
 
407 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  46 
 
 
433 aa  273  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  44.7 
 
 
475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  40.04 
 
 
462 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  42.99 
 
 
449 aa  263  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  43.27 
 
 
413 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  38.87 
 
 
487 aa  252  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  42.86 
 
 
425 aa  249  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  40.36 
 
 
435 aa  249  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  34.15 
 
 
460 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.14 
 
 
464 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  35.98 
 
 
482 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.25 
 
 
464 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.95 
 
 
464 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.95 
 
 
464 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  39.38 
 
 
461 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.95 
 
 
464 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.95 
 
 
464 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.71 
 
 
484 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.66 
 
 
464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.66 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.47 
 
 
492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.66 
 
 
464 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.36 
 
 
464 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  31.54 
 
 
467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.47 
 
 
484 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.89 
 
 
481 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.33 
 
 
481 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.56 
 
 
477 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  36.17 
 
 
469 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  39.93 
 
 
403 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  38.64 
 
 
485 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.28 
 
 
476 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.28 
 
 
476 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  35.84 
 
 
483 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  32.64 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.12 
 
 
476 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  37.28 
 
 
414 aa  173  6.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  38.99 
 
 
425 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.92 
 
 
476 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  41.2 
 
 
455 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  35.87 
 
 
402 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  37.54 
 
 
395 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  44.71 
 
 
394 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  41.85 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  40 
 
 
390 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  40.4 
 
 
484 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  44.44 
 
 
397 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  44.31 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  31.97 
 
 
486 aa  163  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  36.36 
 
 
398 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  36.36 
 
 
398 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  36.4 
 
 
395 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  38.29 
 
 
403 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  31.42 
 
 
465 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  37.74 
 
 
399 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  34.64 
 
 
395 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  43.77 
 
 
376 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  37.36 
 
 
399 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  38.64 
 
 
466 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  35.17 
 
 
406 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  31.7 
 
 
498 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  37.36 
 
 
399 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  43.56 
 
 
372 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  36.04 
 
 
506 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  40.31 
 
 
451 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  36.98 
 
 
399 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  37.97 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  36.98 
 
 
399 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  36.36 
 
 
391 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  28.02 
 
 
456 aa  153  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  36.98 
 
 
399 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  37.97 
 
 
391 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  36.98 
 
 
399 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  38.35 
 
 
391 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  36.36 
 
 
391 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  33.72 
 
 
391 aa  154  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  37.97 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  37.97 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  35.12 
 
 
391 aa  153  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  36.98 
 
 
399 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  35.12 
 
 
391 aa  153  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  43.31 
 
 
365 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  36.36 
 
 
391 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  37.75 
 
 
391 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  36.36 
 
 
391 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  36.98 
 
 
399 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  37.75 
 
 
391 aa  152  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  37.81 
 
 
401 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  36.36 
 
 
391 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  36.36 
 
 
391 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>