More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21330 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  100 
 
 
477 aa  910    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  63.27 
 
 
435 aa  481  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  60 
 
 
485 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  59.13 
 
 
473 aa  471  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  62.28 
 
 
445 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  62.33 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  53.68 
 
 
539 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  56.74 
 
 
449 aa  409  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  47.75 
 
 
451 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  47.33 
 
 
447 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  46.51 
 
 
399 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  46.74 
 
 
399 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  46.28 
 
 
399 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  46.28 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  45.58 
 
 
399 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  46.05 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  46.05 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  46.05 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  46.05 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  46.05 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  45.81 
 
 
399 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 
398 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 
398 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  47.75 
 
 
438 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 
404 aa  309  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  39.69 
 
 
474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  39.24 
 
 
473 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  39.69 
 
 
474 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  39.69 
 
 
474 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
472 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  38.83 
 
 
474 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  39.49 
 
 
476 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.03 
 
 
472 aa  295  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 
451 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  36.94 
 
 
455 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  40.58 
 
 
467 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  37.56 
 
 
455 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  38.91 
 
 
478 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  38.91 
 
 
478 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  38.91 
 
 
478 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  38.91 
 
 
478 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  38.91 
 
 
478 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  38.91 
 
 
478 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  38.91 
 
 
478 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  39.14 
 
 
473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  35.97 
 
 
459 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  39.55 
 
 
509 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
451 aa  277  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  36.44 
 
 
457 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  36.69 
 
 
388 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  41.31 
 
 
382 aa  258  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  45.48 
 
 
382 aa  259  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  44.99 
 
 
372 aa  254  3e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
456 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  40.94 
 
 
381 aa  249  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  37.56 
 
 
459 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  41.85 
 
 
436 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  39.95 
 
 
436 aa  243  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  40.97 
 
 
436 aa  243  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  40.97 
 
 
436 aa  243  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  36.53 
 
 
456 aa  239  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 
465 aa  239  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  34.89 
 
 
514 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  39.13 
 
 
464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  35.49 
 
 
526 aa  236  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  39.6 
 
 
437 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  39.25 
 
 
415 aa  230  4e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  35.97 
 
 
437 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  35.84 
 
 
438 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  36.09 
 
 
438 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  38.19 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 
380 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  37.5 
 
 
469 aa  202  8e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  35.88 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  35.88 
 
 
422 aa  201  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
446 aa  200  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.53 
 
 
464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  32.33 
 
 
463 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
447 aa  192  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  31.36 
 
 
461 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  32.85 
 
 
460 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
461 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  35.41 
 
 
434 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
466 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  31.49 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.72 
 
 
468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 
450 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
454 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  31.03 
 
 
424 aa  179  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  31.86 
 
 
480 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  31.17 
 
 
480 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  31.17 
 
 
480 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.01 
 
 
474 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
459 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  28.94 
 
 
476 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
460 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.99 
 
 
450 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>