46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  100 
 
 		 187 aa  364  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  36.26 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  37.2 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.33 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  28.16 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  31.11 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  32.58 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  32.96 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  32.28 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  26.35 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  29.48 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  33.55 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  33.92 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  33.55 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  26.37 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  28.95 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  28.89 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 102 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  28.11 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 118 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 111 aa  44.7  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  31.82 
 
 		 110 aa  44.7  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  44.7  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  30.14 
 
 		 104 aa  42  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 120 aa  40.8  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>