More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20520 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  100 
 
 
171 aa  346  8e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  71.25 
 
 
162 aa  232  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  65.7 
 
 
162 aa  217  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  66.67 
 
 
162 aa  216  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  62.79 
 
 
168 aa  211  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  62.79 
 
 
163 aa  209  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  59.06 
 
 
166 aa  205  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  62.79 
 
 
162 aa  201  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  59.32 
 
 
172 aa  200  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  62.66 
 
 
173 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  65.58 
 
 
173 aa  198  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  66.67 
 
 
166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  64.29 
 
 
168 aa  195  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  63.95 
 
 
165 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  58.82 
 
 
170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  64.57 
 
 
167 aa  187  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  59.3 
 
 
169 aa  187  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  59.26 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1694  30S ribosomal protein S9  62.57 
 
 
163 aa  180  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.390598  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0253  ribosomal protein S9  62.57 
 
 
162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  66.41 
 
 
162 aa  174  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  65.38 
 
 
135 aa  171  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  52.98 
 
 
167 aa  167  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  62.2 
 
 
174 aa  167  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  66.41 
 
 
161 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  58.76 
 
 
171 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  61.42 
 
 
139 aa  164  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  60.42 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  60.42 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  60.42 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  54.44 
 
 
171 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  64.12 
 
 
130 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  60.31 
 
 
130 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  60.31 
 
 
130 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  65.57 
 
 
135 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  64.57 
 
 
151 aa  147  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  60.31 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6564  ribosomal protein S9  61.79 
 
 
216 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0743813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
154 aa  144  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  60 
 
 
131 aa  142  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  58.78 
 
 
130 aa  141  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 
131 aa  141  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  57.25 
 
 
130 aa  141  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  57.25 
 
 
130 aa  140  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  54.96 
 
 
130 aa  140  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  60.48 
 
 
131 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  60.48 
 
 
131 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  54.96 
 
 
130 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  57.26 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  61.6 
 
 
132 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  60.8 
 
 
131 aa  138  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  56.49 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3863  30S ribosomal protein S9  58.21 
 
 
154 aa  137  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  58.02 
 
 
130 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  55.73 
 
 
130 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  58.02 
 
 
130 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4253  30S ribosomal protein S9  58.21 
 
 
154 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  50 
 
 
264 aa  133  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 
158 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  55.73 
 
 
130 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  53.44 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  54.2 
 
 
130 aa  131  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
137 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  54.96 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  54.2 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  56.45 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  54.2 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
135 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 
135 aa  130  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
135 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 
130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
132 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  56.45 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2043  ribosomal protein S9  53.44 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  51.15 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
138 aa  128  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23301  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
135 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
137 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  56 
 
 
132 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
128 aa  127  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
133 aa  127  7.000000000000001e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1982  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 
133 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0810268  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  54.96 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
134 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2984  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
136 aa  127  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 
130 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  56.49 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  53.44 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  53.44 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>