67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20180 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20180    100 
 
 		 3818 bp  7569    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  82 
 
 		 1344 bp  684    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  81.91 
 
 		 1344 bp  676    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  81.89 
 
 		 1344 bp  706    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  81.83 
 
 		 1344 bp  668    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  81.67 
 
 		 1344 bp  682    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  99.85 
 
 		 1350 bp  2660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  99.63 
 
 		 1350 bp  2637    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  100 
 
 		 1350 bp  2676    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  100 
 
 		 1137 bp  2254    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  99.93 
 
 		 1350 bp  2668    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  94.46 
 
 		 957 bp  1197    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    99.79 
 
 		 2767 bp  2835    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  99.85 
 
 		 1350 bp  2660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00970    97.74 
 
 		 231 bp  319  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  80.22 
 
 		 1389 bp  222  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3471    80.22 
 
 		 3127 bp  222  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157183  hitchhiker  0.00172393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  80.22 
 
 		 1389 bp  222  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    80.22 
 
 		 3175 bp  222  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  80.22 
 
 		 1389 bp  222  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  80.22 
 
 		 1389 bp  222  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  80.22 
 
 		 1389 bp  222  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4282    79.9 
 
 		 1131 bp  220  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.921914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  79.85 
 
 		 1380 bp  206  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  79.85 
 
 		 1380 bp  206  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    79.85 
 
 		 6126 bp  206  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  80.55 
 
 		 951 bp  161  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3734    79.67 
 
 		 2860 bp  159  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.222012  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  79.71 
 
 		 1368 bp  157  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  79.71 
 
 		 1368 bp  157  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  79.71 
 
 		 1368 bp  157  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  85.86 
 
 		 1356 bp  155  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  85.86 
 
 		 1356 bp  155  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15100    84.56 
 
 		 1065 bp  103  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  80 
 
 		 1389 bp  95.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  80 
 
 		 1389 bp  95.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1742    80 
 
 		 2735 bp  95.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  80 
 
 		 1389 bp  95.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2591    80 
 
 		 2288 bp  95.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  80 
 
 		 1389 bp  95.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  80 
 
 		 1389 bp  95.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20950    87.65 
 
 		 351 bp  81.8  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  80.86 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  80.86 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  80.86 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  80.86 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  80.86 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  95.12 
 
 		 990 bp  65.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  91.49 
 
 		 990 bp  61.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  91.49 
 
 		 990 bp  61.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  91.49 
 
 		 990 bp  61.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.74 
 
 		 444 bp  60  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  86.15 
 
 		 1275 bp  58  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0470    91.11 
 
 		 767 bp  58  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  91.11 
 
 		 219 bp  58  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  92.68 
 
 		 999 bp  58  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17760    89.8 
 
 		 534 bp  58  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.473105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  92.68 
 
 		 999 bp  58  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  85.29 
 
 		 987 bp  56  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4445    87.5 
 
 		 129 bp  56  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3645    89.36 
 
 		 309 bp  54  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.31 
 
 		 984 bp  54  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0685    92.11 
 
 		 992 bp  52  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3661  transposase mutator type  94.12 
 
 		 1299 bp  52  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.356207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  92.11 
 
 		 519 bp  52  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0512    89.13 
 
 		 415 bp  52  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.294956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  92.11 
 
 		 1269 bp  52  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>