82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20060 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  321  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  54.09 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  53.55 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  49.06 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  52.2 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  50.31 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  50.31 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  52.53 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  48.77 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  41.46 
 
 		 153 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  43.4 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  44.03 
 
 		 150 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  42.33 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  42.77 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  42.77 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  45.27 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  42.31 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  43.59 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  47.47 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  40.85 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  40.76 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  34.62 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  34.78 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  32.92 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  30.22 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  46.38 
 
 		 71 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  54.84 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  48.53 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  46.88 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.33 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.94 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.85 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.69 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.69 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  48.33 
 
 		 86 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.99 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.5 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  29.06 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  34.12 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.01 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.01 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  30.09 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  29.9 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  25.97 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  29.9 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  28.81 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  27.34 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.88 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.76 
 
 		 202 aa  44.3  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  30.66 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  28 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  29.29 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  29.2 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  30.09 
 
 		 200 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  22.09 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  29.29 
 
 		 198 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  29.29 
 
 		 198 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.08 
 
 		 212 aa  42  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  29.29 
 
 		 198 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  29.29 
 
 		 198 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  29.29 
 
 		 198 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  29.29 
 
 		 198 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  29.29 
 
 		 198 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 		 199 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  28.32 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  26.36 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  23.38 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  28.32 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  28.18 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  28.18 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  28.32 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 		 199 aa  40.8  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 		 199 aa  40.8  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  42 
 
 		 203 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 		 199 aa  40.8  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>