206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19750 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19750  cation/cationic drug transporter  100 
 
 		 105 aa  198  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00047223  normal  0.0181194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  65.38 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  59.62 
 
 		 104 aa  121  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  58.65 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3492  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3765  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1175  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0300462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3491  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3764  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  43.27 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  39.62 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  38.32 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  51.43 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  41.38 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.41 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5569  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3295  small multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1510  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0711515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  41.41 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.41 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.41 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.41 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.41 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  41.41 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.41 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4324  sugE protein  39.81 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0909  sugE protein  39.81 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000446848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4068  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  43.43 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4288  sugE protein  39.81 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.948578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3967  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4343  sugE protein  39.81 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4115  sugE protein  39.81 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3956  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4435  sugE protein  39.81 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.944937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4232  sugE protein  39.81 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  38.24 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  38.24 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  36.54 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  41.41 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.05 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  39.22 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  40 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1212  small multidrug resistance protein  39.33 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0428006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  40.38 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>