More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  74.65 
 
 		 630 aa  954    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2163  GTP-binding protein TypA  65.29 
 
 		 642 aa  811    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  74.56 
 
 		 617 aa  965    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  65.99 
 
 		 640 aa  852    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  74.14 
 
 		 622 aa  946    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  74.33 
 
 		 630 aa  947    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  51.28 
 
 		 614 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1268  GTP-binding protein TypA  66.67 
 
 		 629 aa  871    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  51.28 
 
 		 614 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  51.28 
 
 		 614 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  51.28 
 
 		 614 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0793  GTP-binding protein TypA  70.81 
 
 		 635 aa  908    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0246  membrane GTPase for stress response  64.05 
 
 		 643 aa  825    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.107779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1144  GTP-binding protein TypA  65.88 
 
 		 635 aa  827    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  72.45 
 
 		 636 aa  919    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  66.72 
 
 		 620 aa  853    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 		 614 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  74.84 
 
 		 650 aa  960    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  51.28 
 
 		 614 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  75.08 
 
 		 620 aa  961    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11190  GTP-binding translation elongation factor typA  63.81 
 
 		 628 aa  796    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11090  GTP-binding protein TypA/BipA  69.58 
 
 		 640 aa  898    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0960389  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  55.85 
 
 		 594 aa  659    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0480  GTP-binding protein TypA  63.95 
 
 		 641 aa  822    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  70.85 
 
 		 613 aa  901    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  55.23 
 
 		 608 aa  680    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  51.28 
 
 		 614 aa  638    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4269  GTP-binding protein TypA  66.51 
 
 		 633 aa  818    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0578  GTP-binding protein TypA  56.08 
 
 		 609 aa  665    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0310674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 		 615 aa  644    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  51.28 
 
 		 614 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  53.25 
 
 		 605 aa  662    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  69.61 
 
 		 624 aa  881    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0962  GTP-binding protein TypA  70.95 
 
 		 645 aa  905    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0622618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  66.56 
 
 		 636 aa  846    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  53.27 
 
 		 615 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  69.9 
 
 		 620 aa  905    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 		 608 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  74.24 
 
 		 641 aa  958    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  74.72 
 
 		 617 aa  979    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0759  GTP-binding protein TypA  66.77 
 
 		 633 aa  855    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00250463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  71.97 
 
 		 645 aa  931    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  56.19 
 
 		 608 aa  691    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4540  GTP-binding protein TypA  64.95 
 
 		 634 aa  822    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 616 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  51.12 
 
 		 614 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  54.08 
 
 		 605 aa  676    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 593 aa  645    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  52.42 
 
 		 612 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4040  GTP-binding protein TypA  66.51 
 
 		 633 aa  818    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26090  GTP-binding protein TypA/BipA  70.66 
 
 		 636 aa  919    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.876916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  73.98 
 
 		 617 aa  952    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  53.58 
 
 		 610 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.9 
 
 		 610 aa  665    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  52.26 
 
 		 608 aa  636    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  51.28 
 
 		 614 aa  639    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  50.96 
 
 		 614 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  53.8 
 
 		 606 aa  663    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  100 
 
 		 629 aa  1272    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  69.57 
 
 		 642 aa  899    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  77.6 
 
 		 630 aa  985    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  51.92 
 
 		 615 aa  636    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  68.61 
 
 		 642 aa  903    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 608 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 		 594 aa  661    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  70.89 
 
 		 633 aa  908    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 		 615 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4115  GTP-binding protein TypA  66.51 
 
 		 633 aa  818    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  76.22 
 
 		 631 aa  987    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  52.16 
 
 		 616 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  50.96 
 
 		 614 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  51.28 
 
 		 613 aa  630  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  51.38 
 
 		 610 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 		 613 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  52.28 
 
 		 602 aa  628  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 		 613 aa  625  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  49.6 
 
 		 615 aa  624  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  51.29 
 
 		 627 aa  622  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  50.57 
 
 		 603 aa  624  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  49.6 
 
 		 615 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  49.6 
 
 		 615 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  52.1 
 
 		 614 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  52.32 
 
 		 592 aa  621  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  51.28 
 
 		 613 aa  619  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  50.32 
 
 		 613 aa  616  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  50.96 
 
 		 614 aa  618  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  50.64 
 
 		 619 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 600 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  51.47 
 
 		 602 aa  615  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.8 
 
 		 598 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  49.51 
 
 		 602 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  52.2 
 
 		 605 aa  610  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  51.47 
 
 		 598 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  50.72 
 
 		 614 aa  611  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  51.05 
 
 		 600 aa  609  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.38 
 
 		 601 aa  611  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  50.9 
 
 		 613 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  49.18 
 
 		 602 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  51.38 
 
 		 601 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  50.82 
 
 		 601 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>