68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19250 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1003    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  35.82 
 
 		 464 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  38.15 
 
 		 466 aa  212  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  36.81 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  34.35 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  31.68 
 
 		 529 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  32.41 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  33.8 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  33.57 
 
 		 531 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  33.57 
 
 		 531 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  31.04 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  31.15 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  30.07 
 
 		 461 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  30.97 
 
 		 529 aa  159  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  32.04 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  33.71 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  31.18 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  30.18 
 
 		 448 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  24.94 
 
 		 498 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  30.39 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  23.74 
 
 		 511 aa  103  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  23.38 
 
 		 634 aa  91.3  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.87 
 
 		 256 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  22.48 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  23.51 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  25.19 
 
 		 257 aa  62  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  22.71 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  22.88 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  23.51 
 
 		 258 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  23.19 
 
 		 289 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  22.18 
 
 		 260 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  24.91 
 
 		 251 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  28.68 
 
 		 157 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  22.52 
 
 		 266 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  21.92 
 
 		 260 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  26.21 
 
 		 251 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  23.05 
 
 		 258 aa  50.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  23.05 
 
 		 274 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  21.54 
 
 		 259 aa  50.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  23.05 
 
 		 277 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  23.05 
 
 		 277 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  23.05 
 
 		 277 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  23.05 
 
 		 256 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  23.05 
 
 		 256 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  23.05 
 
 		 256 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  23.05 
 
 		 256 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  22.22 
 
 		 274 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  25.13 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  26.32 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  26.32 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  26.32 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  28 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  26.95 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  20.23 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  26.32 
 
 		 406 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  28.26 
 
 		 247 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  22.73 
 
 		 314 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  26.32 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  26.32 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  22.73 
 
 		 314 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  22.73 
 
 		 314 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  22.73 
 
 		 314 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  26.32 
 
 		 406 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  21.84 
 
 		 303 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  25.16 
 
 		 422 aa  43.9  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  23.53 
 
 		 411 aa  43.5  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  21.89 
 
 		 262 aa  43.5  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>