209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19170 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  100 
 
 
640 aa  1267  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  33.55 
 
 
673 aa  320  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  32.67 
 
 
760 aa  319  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  33.55 
 
 
670 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 
670 aa  316  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.92 
 
 
763 aa  316  7e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  33.92 
 
 
764 aa  315  1e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  38.79 
 
 
852 aa  313  6e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  33.99 
 
 
622 aa  312  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.33 
 
 
669 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 
637 aa  310  6e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  35.51 
 
 
607 aa  306  8e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.58 
 
 
666 aa  305  2e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  31.99 
 
 
616 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.12153e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  34.93 
 
 
619 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 
601 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 
608 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  33.12 
 
 
625 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.30765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  35.02 
 
 
611 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  34.14 
 
 
602 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  33.01 
 
 
660 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.62767e-05  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  35.07 
 
 
611 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  34.36 
 
 
601 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  34.36 
 
 
601 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  33.01 
 
 
660 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.55921e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  32.85 
 
 
660 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  33.01 
 
 
660 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  32.96 
 
 
598 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  33.22 
 
 
643 aa  289  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  33.76 
 
 
719 aa  289  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  32.64 
 
 
604 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 
651 aa  287  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 
702 aa  286  1e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
611 aa  282  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  30.5 
 
 
597 aa  282  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  30.68 
 
 
599 aa  279  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  30.29 
 
 
596 aa  279  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 
596 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.29 
 
 
596 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.29 
 
 
596 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.29 
 
 
596 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.45 
 
 
596 aa  278  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.29 
 
 
596 aa  276  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  5.477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  33.76 
 
 
599 aa  275  1e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 
617 aa  270  6e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
602 aa  268  3e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 
616 aa  267  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  31.49 
 
 
606 aa  256  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  30.81 
 
 
569 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 
623 aa  227  6e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  26.01 
 
 
595 aa  211  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 
609 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 
607 aa  194  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  27.44 
 
 
625 aa  191  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 
584 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 
741 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
629 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  35.61 
 
 
407 aa  156  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 
660 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 
640 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 
637 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 
652 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 
652 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  24.95 
 
 
612 aa  143  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  27.12 
 
 
639 aa  142  1e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 
610 aa  140  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 
628 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  25.84 
 
 
617 aa  136  1e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  27 
 
 
641 aa  130  1e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  25.84 
 
 
617 aa  126  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.27 
 
 
626 aa  124  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  27.46 
 
 
628 aa  121  5e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  28.7 
 
 
630 aa  118  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  30.61 
 
 
593 aa  102  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  28.17 
 
 
620 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 
399 aa  95.5  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.19 
 
 
401 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.41 
 
 
401 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  27.65 
 
 
581 aa  88.2  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 
581 aa  87.4  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  28.93 
 
 
421 aa  86.3  2e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  27.87 
 
 
576 aa  84.7  5e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.89 
 
 
399 aa  84.3  6e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  28.77 
 
 
580 aa  83.6  1e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  26.44 
 
 
414 aa  81.6  4e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  26.05 
 
 
414 aa  79.7  1e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.06 
 
 
421 aa  77.8  6e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  27.79 
 
 
597 aa  77.8  6e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  29.67 
 
 
569 aa  77  9e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 
496 aa  77  1e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 
597 aa  76.3  2e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 
605 aa  74.3  6e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.88 
 
 
596 aa  73.9  9e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  26.03 
 
 
576 aa  71.6  4e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  26.03 
 
 
576 aa  71.2  5e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.88 
 
 
414 aa  71.2  5e-11  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  26.03 
 
 
576 aa  71.6  5e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  26.03 
 
 
576 aa  71.6  5e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
572 aa  70.1  1e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  23.44 
 
 
487 aa  69.3  2e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>