61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18360 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  100 
 
 		 141 aa  267  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  48.55 
 
 		 181 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  48.55 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  51.8 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  45.99 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  41.26 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  42.65 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  41.13 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  50 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  42.11 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  40.74 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  40.3 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  48.23 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  38.52 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  40.91 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  40.15 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  43.8 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  43.8 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  43.8 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  38.52 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  33.57 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  32.87 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  31.88 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  32.37 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  40.77 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  37.96 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  40.15 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  39.56 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.77 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  39.26 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  35 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  41.3 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  39.13 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  32.61 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  39.69 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  27.21 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  27.82 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0690  protein of unknown function DUF107  25.9 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  34.85 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  24.27 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  35.46 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  28.12 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  36.36 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  36.11 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  35.88 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  34.72 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  37.5 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  24.14 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  34.72 
 
 		 145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  27.08 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  33.63 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.06 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  25.53 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  26.53 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>