18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18090  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  473  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3169  hypothetical protein  44.55 
 
 
198 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1836  hypothetical protein  43.4 
 
 
197 aa  132  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301761  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2417  hypothetical protein  38.86 
 
 
199 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1703  hypothetical protein  43.59 
 
 
210 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.338855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1401  hypothetical protein  36.49 
 
 
224 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.89013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0301  hypothetical protein  35.38 
 
 
199 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1332  hypothetical protein  37.1 
 
 
221 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.386362  normal  0.4731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2130  hypothetical protein  41.8 
 
 
195 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0142  hypothetical protein  37.44 
 
 
199 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1413  hypothetical protein  31.95 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2093  hypothetical protein  39.15 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0050672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2029  hypothetical protein  37.26 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0861085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01170  hypothetical protein  34 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12070  hypothetical protein  45.21 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0543745  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14690  MarR family regulator  32.95 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15490  SatD  27.72 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.163286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1008  hypothetical protein  28.49 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>