215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18060 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  100 
 
 
433 aa  864    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  55.42 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  55.81 
 
 
390 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  56.38 
 
 
388 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  54.92 
 
 
363 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  47.64 
 
 
419 aa  346  5e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  47.14 
 
 
438 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  48.28 
 
 
402 aa  332  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  43.09 
 
 
420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  39.95 
 
 
415 aa  253  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  39.32 
 
 
399 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  37.59 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  42.94 
 
 
444 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  40.27 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  37.12 
 
 
429 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  37.97 
 
 
399 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  36.14 
 
 
402 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  30.55 
 
 
381 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  34.21 
 
 
307 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  36.01 
 
 
412 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  33.13 
 
 
311 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  37.6 
 
 
418 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  36.25 
 
 
412 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  30.5 
 
 
311 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  34.06 
 
 
312 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  31.96 
 
 
333 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  28.57 
 
 
439 aa  168  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  32.39 
 
 
315 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.23 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  30.72 
 
 
313 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  31.07 
 
 
419 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  32.24 
 
 
449 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  32.42 
 
 
392 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  28.57 
 
 
409 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  32.2 
 
 
428 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  32.93 
 
 
405 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  31.75 
 
 
345 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  29.09 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  28.46 
 
 
326 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  31.5 
 
 
350 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.14 
 
 
602 aa  151  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  32.65 
 
 
338 aa  150  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  28.69 
 
 
412 aa  149  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  28.66 
 
 
320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  28.97 
 
 
320 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  29.97 
 
 
345 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  29.15 
 
 
311 aa  143  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  30.49 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  30.65 
 
 
355 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  30.15 
 
 
355 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  30.93 
 
 
360 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  28.4 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  31.07 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  28.25 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  27.42 
 
 
332 aa  133  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  31.23 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  26.54 
 
 
323 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.47 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  25.21 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  29.82 
 
 
357 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  27.3 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  26.35 
 
 
323 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  26.92 
 
 
323 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  27.1 
 
 
325 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  31.54 
 
 
355 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  30.4 
 
 
306 aa  126  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  27.04 
 
 
307 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  31.38 
 
 
355 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  31.38 
 
 
307 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  31.58 
 
 
444 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  25.72 
 
 
328 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  26.52 
 
 
464 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  26.13 
 
 
323 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  25.71 
 
 
323 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  28.31 
 
 
346 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  27.3 
 
 
323 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  28.25 
 
 
462 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  32.19 
 
 
323 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  27.5 
 
 
368 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.71 
 
 
323 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  25.71 
 
 
323 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  25.71 
 
 
323 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  25.4 
 
 
323 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  25.4 
 
 
323 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  28.68 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  27.3 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  28.34 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  26.03 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  26.03 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  26.03 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  26.03 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  26.03 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  29.69 
 
 
315 aa  121  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  26.52 
 
 
447 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  26.87 
 
 
344 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  28.46 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  26.28 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  26.28 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  27.16 
 
 
456 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  25 
 
 
323 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>