76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18050 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  90.77 
 
 		 538 aa  890    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1149    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  91.55 
 
 		 526 aa  876    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  58.38 
 
 		 522 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  55.97 
 
 		 524 aa  505  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  43.75 
 
 		 535 aa  355  8.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21450  hypothetical protein  41.05 
 
 		 384 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000664219  hitchhiker  0.0000176037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  37.22 
 
 		 414 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  34.34 
 
 		 414 aa  146  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  35.59 
 
 		 414 aa  127  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  37.94 
 
 		 255 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  29.21 
 
 		 494 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  27.58 
 
 		 561 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  29.21 
 
 		 551 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  27.13 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  28.88 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  32.29 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  27.54 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  25 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  31.65 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  28.06 
 
 		 572 aa  79  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  34.27 
 
 		 661 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  27.69 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  27.3 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  28.66 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  29.41 
 
 		 408 aa  66.6  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  25.98 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  25 
 
 		 627 aa  63.9  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  25.83 
 
 		 532 aa  62  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  26.74 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  31.54 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  26.74 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  32.59 
 
 		 391 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  30.63 
 
 		 499 aa  57  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  23.9 
 
 		 451 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  30.08 
 
 		 454 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  24.85 
 
 		 489 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  26.65 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  25.69 
 
 		 446 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  30.17 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  29.84 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  26.13 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  29.85 
 
 		 628 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  30 
 
 		 505 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  26.58 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  27.06 
 
 		 508 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  26.32 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  26.32 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  26.76 
 
 		 444 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  26.76 
 
 		 444 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.16 
 
 		 499 aa  48.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  26.26 
 
 		 448 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  33.68 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  25.08 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  27.48 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  24.69 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  24.69 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  27.06 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  29.85 
 
 		 605 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  26 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  27.06 
 
 		 418 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  33.8 
 
 		 566 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  25.5 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.5 
 
 		 580 aa  45.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  25.46 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  26.09 
 
 		 444 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  32.98 
 
 		 433 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  32.98 
 
 		 433 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  32.63 
 
 		 428 aa  43.9  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  27.24 
 
 		 508 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  29.51 
 
 		 584 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  24.92 
 
 		 492 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  25.71 
 
 		 497 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  27.63 
 
 		 558 aa  43.5  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  24.92 
 
 		 492 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>