26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17670  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  560  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.276623  normal  0.654681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4467  secreted protein  45.2 
 
 		 423 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2117  secreted protein  40.11 
 
 		 415 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2869  hypothetical protein  40.91 
 
 		 537 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0052  hypothetical protein  48.84 
 
 		 553 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00620  hypothetical protein  43.7 
 
 		 553 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486509  normal  0.628936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2682  hypothetical protein  30.39 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6996  hypothetical protein  42.45 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1934  hypothetical protein  40.27 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0578  hypothetical protein  52.24 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.056117  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0733  hypothetical protein  44.44 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2971  hypothetical protein  59.57 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0546  hypothetical protein  52.08 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4131  hypothetical protein  47.3 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0130576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3158  hypothetical protein  39.19 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0013201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0812  hypothetical protein  39.19 
 
 		 389 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000162038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0837  hypothetical protein  39.19 
 
 		 389 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.240462  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0693  hypothetical protein  30.51 
 
 		 385 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226756  normal  0.897132 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0844  hypothetical protein  39.19 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3329  hypothetical protein  30.51 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3441  hypothetical protein  30.51 
 
 		 385 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00415893  normal  0.25947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3523  hypothetical protein  40.58 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0015438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3969  hypothetical protein  33.04 
 
 		 390 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0603  hypothetical protein  37.84 
 
 		 386 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0835  hypothetical protein  52.38 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3221  hypothetical protein  32.38 
 
 		 386 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0332861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>