More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17400 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  53.33 
 
 		 685 aa  667    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  56.85 
 
 		 681 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  100 
 
 		 765 aa  1507    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  56.19 
 
 		 674 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  58.65 
 
 		 672 aa  682    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.59 
 
 		 694 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  53.58 
 
 		 690 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  55.29 
 
 		 684 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.78 
 
 		 666 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  55.92 
 
 		 670 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  52.09 
 
 		 699 aa  635  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  56.39 
 
 		 676 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  56.09 
 
 		 665 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  56.09 
 
 		 665 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  56.09 
 
 		 665 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  54.33 
 
 		 728 aa  626  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  51.16 
 
 		 706 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  52.26 
 
 		 692 aa  619  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  51.2 
 
 		 673 aa  614  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  55.28 
 
 		 664 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  54.45 
 
 		 677 aa  603  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  52.73 
 
 		 696 aa  596  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  51.4 
 
 		 706 aa  592  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  53.12 
 
 		 699 aa  588  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  50.52 
 
 		 669 aa  575  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  51.38 
 
 		 676 aa  568  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  52.28 
 
 		 679 aa  565  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  48.88 
 
 		 664 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  49.92 
 
 		 683 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  50.08 
 
 		 699 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  56.35 
 
 		 710 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  49.69 
 
 		 844 aa  365  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  33.07 
 
 		 636 aa  300  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  27.76 
 
 		 832 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  32.35 
 
 		 658 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.49 
 
 		 674 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  33.49 
 
 		 660 aa  274  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  33.49 
 
 		 650 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  33.64 
 
 		 650 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  34.2 
 
 		 643 aa  272  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  32.9 
 
 		 754 aa  271  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  32.46 
 
 		 646 aa  270  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.67 
 
 		 641 aa  270  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  33.02 
 
 		 640 aa  270  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.62 
 
 		 636 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.62 
 
 		 636 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.62 
 
 		 636 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.28 
 
 		 930 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.62 
 
 		 636 aa  269  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  34.67 
 
 		 639 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  32.62 
 
 		 636 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  32.78 
 
 		 634 aa  268  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  28.03 
 
 		 709 aa  267  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  32.13 
 
 		 851 aa  266  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  32.52 
 
 		 636 aa  265  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.52 
 
 		 636 aa  264  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  32.52 
 
 		 636 aa  265  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  32.52 
 
 		 636 aa  264  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  32.52 
 
 		 636 aa  264  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  32.52 
 
 		 636 aa  264  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  32.52 
 
 		 636 aa  264  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  32.52 
 
 		 636 aa  264  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  33.89 
 
 		 639 aa  264  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  32.76 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  33.28 
 
 		 639 aa  264  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  32.47 
 
 		 743 aa  264  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  33.38 
 
 		 647 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  34.68 
 
 		 649 aa  263  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  32.19 
 
 		 634 aa  263  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  32.19 
 
 		 634 aa  262  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  32.36 
 
 		 636 aa  261  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  32.72 
 
 		 639 aa  261  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  34.79 
 
 		 651 aa  261  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.84 
 
 		 921 aa  261  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  32.84 
 
 		 634 aa  260  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  30.71 
 
 		 664 aa  260  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  35.02 
 
 		 675 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  33.22 
 
 		 641 aa  258  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  33.22 
 
 		 641 aa  258  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  31.49 
 
 		 659 aa  255  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  33.23 
 
 		 651 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  26.93 
 
 		 667 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  30.9 
 
 		 707 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.1 
 
 		 646 aa  254  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  30.19 
 
 		 674 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  30.67 
 
 		 640 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  30.52 
 
 		 669 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  30.19 
 
 		 659 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  30.98 
 
 		 646 aa  252  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  30.37 
 
 		 640 aa  252  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  32.57 
 
 		 838 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  31.93 
 
 		 644 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.45 
 
 		 952 aa  251  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  30.24 
 
 		 659 aa  251  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  30.78 
 
 		 669 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  30.52 
 
 		 640 aa  251  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  30.03 
 
 		 633 aa  251  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  34.05 
 
 		 649 aa  250  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  31.34 
 
 		 653 aa  250  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  31.1 
 
 		 645 aa  248  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>