More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17270 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  641    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 288 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  45.6 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  45.14 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  43.91 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  43.29 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  37.41 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  35.95 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 313 aa  159  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 324 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  35.41 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  38.65 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 295 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  38.65 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  35.03 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  35.98 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  31.48 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  35.53 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  33.86 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  35.18 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 295 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  37.95 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  34.85 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.09 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  32.84 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.22 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  28.34 
 
 		 288 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.18 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.42 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.42 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.42 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  30.42 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.42 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  36.6 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  35.56 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  31.17 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  32.08 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.04 
 
 		 299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>