112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16880 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  632  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  40.78 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  33.22 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  50 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  36.07 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  35.27 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  39.39 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  40.54 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  35.09 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  39.81 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  42.29 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  39.18 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  39.83 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  38.46 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  30.89 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  29.64 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  36.91 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  35.11 
 
 
278 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3715  hypothetical protein  32.53 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  33.82 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  32.01 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  32.01 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  32.01 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  36.15 
 
 
289 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  45.79 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  37.78 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  30.47 
 
 
325 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  32.5 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  38.74 
 
 
120 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  35.82 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  36.43 
 
 
259 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  30.34 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  32.37 
 
 
283 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  32.34 
 
 
357 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  34.91 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  31.71 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  34.91 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  33.93 
 
 
281 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  35.07 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  33.1 
 
 
379 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  35.64 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  31.67 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  36.3 
 
 
277 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  37.14 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  31.67 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  36.3 
 
 
277 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  30.3 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  37.06 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  31.67 
 
 
284 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  36.36 
 
 
277 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  32.09 
 
 
294 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  31.54 
 
 
279 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  38.02 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  32.19 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  34.13 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  32.19 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  34.13 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  31.97 
 
 
284 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  33.65 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  31.97 
 
 
284 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  31.97 
 
 
284 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  32.19 
 
 
300 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  33.06 
 
 
286 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  33.06 
 
 
286 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  41.24 
 
 
289 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  34.81 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  36.73 
 
 
306 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  35.92 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  32.7 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  31.53 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  27.59 
 
 
285 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  37.86 
 
 
330 aa  49.7  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  32.59 
 
 
293 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  30.34 
 
 
306 aa  49.7  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  34.51 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  27.09 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4023  hypothetical protein  31.44 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  34.68 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  38.24 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  35.34 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  27.4 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2824  protein of unknown function DUF559  28.39 
 
 
283 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0136609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  35.64 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  39.81 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  29.23 
 
 
289 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  30 
 
 
338 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  34.75 
 
 
329 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  29.46 
 
 
319 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  36.51 
 
 
347 aa  45.8  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  30.13 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  27.9 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2475  hypothetical protein  31.72 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  34.19 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  29.25 
 
 
201 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  28.72 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>