More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16820 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 
603 aa  1209    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 
633 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 
601 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  32.41 
 
 
601 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 
592 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  32.3 
 
 
588 aa  331  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 
601 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 
598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 
601 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
597 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 
598 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 
603 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
602 aa  317  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 
601 aa  317  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.62 
 
 
601 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 
607 aa  313  5.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 
598 aa  312  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.17 
 
 
602 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 
601 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 
609 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 
633 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 
601 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
601 aa  309  9e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  35.91 
 
 
600 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 
601 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  30.19 
 
 
611 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 
597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 
597 aa  308  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 
597 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 
597 aa  307  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 
597 aa  308  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 
598 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
597 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.8 
 
 
610 aa  306  9.000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 
601 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  36.16 
 
 
597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  30.7 
 
 
602 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.33 
 
 
599 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 
602 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  31.71 
 
 
568 aa  300  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 
601 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 
610 aa  300  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 
620 aa  299  8e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 
606 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
603 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
591 aa  299  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.65 
 
 
610 aa  298  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 
603 aa  298  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 
598 aa  298  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 
610 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 
603 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
590 aa  293  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 
599 aa  292  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 
610 aa  292  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  31.28 
 
 
587 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 
597 aa  291  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.63 
 
 
597 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.25 
 
 
592 aa  290  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 
607 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 
622 aa  290  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 
597 aa  289  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 
606 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 
592 aa  287  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 
602 aa  286  9e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
615 aa  286  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 
669 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 
602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
612 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
567 aa  283  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 
616 aa  283  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
612 aa  283  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.46 
 
 
611 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 
593 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
663 aa  280  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 
599 aa  279  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.67 
 
 
606 aa  279  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 
597 aa  278  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 
596 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.23 
 
 
598 aa  276  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 
599 aa  276  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 
608 aa  276  8e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 
607 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
652 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
597 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 
600 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.22 
 
 
599 aa  274  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 
632 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 
602 aa  273  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
604 aa  273  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 
594 aa  273  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 
598 aa  273  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.85 
 
 
602 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
599 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 
596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
599 aa  270  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 
612 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.89 
 
 
607 aa  269  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>