More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 207 aa  399  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  54.17 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  54.89 
 
 		 213 aa  137  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  48.45 
 
 		 272 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  41.62 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  51.47 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  47.2 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  44.27 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  50 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  39.9 
 
 		 243 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  50.35 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  49.04 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  46.99 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  40.8 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  42.94 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  49.64 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  50.78 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  50.78 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  42.61 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 		 227 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  41.01 
 
 		 182 aa  98.2  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 291 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 174 aa  94.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  41.33 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  43.93 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 173 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  41.61 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 178 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 197 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  50.85 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 143 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 176 aa  85.1  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 158 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  39.75 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  40 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  35.61 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  41.43 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  34.3 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  35.91 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  44.78 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 169 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  39.52 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  38.58 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  38.76 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  40.25 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.65 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  34.53 
 
 		 145 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  43.66 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  51.92 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  41.73 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  34.91 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.52 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  34.71 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  34.71 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  34.71 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  35.47 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.89 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  36.65 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  32.96 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>