More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15590 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  65.03 
 
 
504 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  65.82 
 
 
505 aa  692    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  64.65 
 
 
514 aa  707    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  62.5 
 
 
505 aa  669    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  63.26 
 
 
504 aa  666    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  64.37 
 
 
502 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  65.04 
 
 
499 aa  638    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  66.47 
 
 
504 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  65.18 
 
 
510 aa  666    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  100 
 
 
514 aa  1040    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  64.31 
 
 
504 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  62.55 
 
 
504 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  67.06 
 
 
505 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  61.91 
 
 
505 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  63.46 
 
 
506 aa  669    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  61.52 
 
 
503 aa  628  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  62.99 
 
 
498 aa  628  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  62.4 
 
 
499 aa  625  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  62.11 
 
 
497 aa  620  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  62.99 
 
 
496 aa  612  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  61.76 
 
 
505 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  58.56 
 
 
505 aa  609  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  58.71 
 
 
503 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  61.57 
 
 
507 aa  608  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  61.61 
 
 
507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  58.66 
 
 
499 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  60.04 
 
 
499 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  60 
 
 
501 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  59.18 
 
 
510 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  59.18 
 
 
510 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  59.84 
 
 
517 aa  591  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  58.27 
 
 
498 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  59.18 
 
 
510 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  59.96 
 
 
500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  58.63 
 
 
500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  58.27 
 
 
499 aa  580  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  61.33 
 
 
506 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  58.04 
 
 
504 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  59.34 
 
 
510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  58.17 
 
 
505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  55.95 
 
 
507 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  57.4 
 
 
499 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  59.37 
 
 
522 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  59.57 
 
 
505 aa  571  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  59.17 
 
 
507 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  60.2 
 
 
505 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  59.3 
 
 
501 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  59.3 
 
 
501 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  59.57 
 
 
505 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  59.69 
 
 
501 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  55.19 
 
 
509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  58.27 
 
 
505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  59.22 
 
 
505 aa  559  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  57.09 
 
 
509 aa  555  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  57.65 
 
 
505 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  57.65 
 
 
505 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  53.65 
 
 
496 aa  548  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  52.16 
 
 
497 aa  545  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  53.25 
 
 
496 aa  543  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  57.34 
 
 
505 aa  545  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  51.57 
 
 
498 aa  536  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  51.87 
 
 
500 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  51.18 
 
 
499 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  51.08 
 
 
500 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  51.47 
 
 
500 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  51.28 
 
 
500 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  51.47 
 
 
500 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  51.47 
 
 
500 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  57.56 
 
 
502 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  51.18 
 
 
499 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  53.14 
 
 
503 aa  528  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  51.77 
 
 
499 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  52.37 
 
 
494 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  50.49 
 
 
505 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  50.98 
 
 
499 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  53.65 
 
 
496 aa  528  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  53.73 
 
 
498 aa  524  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  51.98 
 
 
513 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  52.85 
 
 
497 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  53.94 
 
 
520 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  50.98 
 
 
499 aa  519  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  52.82 
 
 
501 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  50.29 
 
 
503 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  50.29 
 
 
518 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  50.29 
 
 
503 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  52.85 
 
 
497 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  50.59 
 
 
500 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  53.53 
 
 
505 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  50.29 
 
 
518 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  50.29 
 
 
518 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  50.29 
 
 
518 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  50.29 
 
 
518 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  53.82 
 
 
504 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  51.78 
 
 
493 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  52.66 
 
 
497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  52.54 
 
 
503 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  51.94 
 
 
505 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  49.71 
 
 
501 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  50.69 
 
 
500 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  51.35 
 
 
502 aa  514  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>