More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15440 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2287  threonyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 
691 aa  755    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3066  threonyl-tRNA synthetase  71.47 
 
 
656 aa  970    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.408536  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1770  threonyl-tRNA synthetase  67.52 
 
 
671 aa  857    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0365193  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2392  threonyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 
668 aa  820    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451072  hitchhiker  0.00797277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  66.37 
 
 
673 aa  920    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 
677 aa  781    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 
695 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  64.64 
 
 
657 aa  860    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
669 aa  904    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 
666 aa  825    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1656  threonyl-tRNA synthetase  71.38 
 
 
672 aa  947    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 
682 aa  775    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 
670 aa  889    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 
677 aa  833    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 
659 aa  838    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 
658 aa  820    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  68.16 
 
 
676 aa  906    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  66.96 
 
 
666 aa  915    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  58.31 
 
 
684 aa  781    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 
690 aa  792    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1783  threonyl-tRNA synthetase  67.19 
 
 
671 aa  860    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491934  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 
701 aa  825    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  61.88 
 
 
676 aa  850    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 
684 aa  755    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  63.32 
 
 
657 aa  840    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  59.94 
 
 
692 aa  746    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167606  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1979  threonyl-tRNA synthetase  65.83 
 
 
671 aa  862    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000566637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 
684 aa  755    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  65.27 
 
 
672 aa  887    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 
699 aa  777    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15440  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
660 aa  1355    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.374739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  64.49 
 
 
659 aa  850    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 
669 aa  897    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 
692 aa  758    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 
685 aa  848    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  68.92 
 
 
668 aa  941    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 
684 aa  755    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 
691 aa  761    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
644 aa  551  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
644 aa  551  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
636 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
646 aa  547  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
645 aa  545  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
648 aa  548  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
604 aa  541  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
636 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
636 aa  535  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
638 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
636 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
643 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
645 aa  528  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
649 aa  525  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
639 aa  527  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
610 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
583 aa  519  1e-146  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
614 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
615 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
659 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
639 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
644 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
643 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
595 aa  515  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
608 aa  514  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
638 aa  511  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
638 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
596 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
644 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
595 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
611 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
604 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
633 aa  505  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
662 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
608 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
594 aa  502  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
644 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
606 aa  501  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
645 aa  501  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
646 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
644 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
649 aa  496  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
644 aa  498  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
635 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
644 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
647 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
648 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
644 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
611 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
634 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
607 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
581 aa  489  1e-137  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  40.92 
 
 
684 aa  489  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
652 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
637 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
607 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
652 aa  489  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
640 aa  485  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  40 
 
 
652 aa  486  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
647 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
637 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
634 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>