78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15010 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  534  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  32.48 
 
 
286 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2386  hypothetical protein  36.23 
 
 
309 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  31.97 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  38.54 
 
 
316 aa  95.5  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  35.71 
 
 
315 aa  89.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  34.32 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  43.2 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  35.27 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  29.37 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  37.32 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  29.26 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  34.57 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  31.37 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  42.14 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  31.64 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  27.97 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  28.19 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  28.08 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  31.58 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  30.14 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  30.14 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  30.14 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  34.06 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  31.48 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  27.05 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  46.99 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  32.02 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  26.89 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  34.59 
 
 
234 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  34.86 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  44.87 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  30.35 
 
 
234 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  29.07 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  26.41 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  41.11 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  28.16 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  28.57 
 
 
257 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  28.42 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  27.23 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  27.22 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00170  hypothetical protein  31.69 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0524836  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  35.56 
 
 
297 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  30.77 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  27.62 
 
 
263 aa  55.8  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0028  hypothetical protein  24.58 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  26.24 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  29.87 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  26.81 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  37.11 
 
 
242 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  25.11 
 
 
234 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1895  protein of unknown function DUF881  27.8 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  23.33 
 
 
235 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  26.59 
 
 
272 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  25.99 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  34.34 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  34.34 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  34.34 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  31.72 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  38.46 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  29.23 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  30.26 
 
 
309 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  27.42 
 
 
233 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  40.74 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  28.24 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  24.48 
 
 
266 aa  47  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  31.76 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  21.83 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  34.02 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  21.36 
 
 
243 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  32.97 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  31.69 
 
 
309 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  28.94 
 
 
246 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  27.1 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  28.04 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4438  hypothetical protein  33.65 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.226653  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  30.35 
 
 
230 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  38.16 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>